淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群的肠道菌群多样性分析

发布时间：2024-06-29 06:28

　　目的探讨淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群成蚊肠道菌群多样性和组成结构。方法分离淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群成蚊肠道并提取总基因组DNA,对敏感品系与抗性种群成蚊肠道菌群16S rDNA基因的V3+V4区进行测序,分析其物种组成结构、菌群多样性及相对丰度;通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术验证细菌相对丰度以检测测序数据的可靠性。结果通过优化剪切得到216 022条有效序列,根据序列相似性进行聚类分析共获取766个操作分类单元,分别注释到31个门,62个纲,132个目,215个科和339个属。样本覆盖度均接近99%,表明测序量基本覆盖所有细菌物种。敏感品系的Chao1指数、香农指数和辛普森指数分别为374.53±40.27、2.56±0.59和0.36±0.11,抗性种群分别为201.58±29.34、1.14±0.13和0.55±0.07。淡色库蚊敏感品系与抗性种群肠道菌群均以变形菌门和厚壁菌门居多;在目分类水平上,敏感品系的优势菌目分别为红螺菌目、肠杆菌目及伯克霍尔德氏菌目,而抗性种群的优势菌目为红螺菌目、气单胞菌目及乳酸杆菌目;在属分类水平上,敏感品系的优势菌属为未...

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【部分图文】：

图1淡色库蚊敏感品系与抗性种群肠道的OTUs分布维恩图

通过IlluminaMiSeq高通量测序对敏感品系与抗性种群肠道细菌16SrDNA基因V3+V4可变区进行测序分析，共产生435843条原始序列，经过两端序列拼接优化后得到216022条有效序列。样本中99.99%的序列在400～600bp之间，平均长度为429b....

图2稀释曲线和Rank-abundance曲线

通过随机抽取测序序列与其所代表的OTU数目绘制稀释曲线来分析测序数据的饱和程度（图2），结果显示，随着测序深度加深，敏感品系肠道测序的稀释曲线趋于平缓并接近饱和，表明获得的测序量能够客观反映敏感品系肠道的所有细菌类群；抗性种群的稀释曲线在97%相似水平下曲线斜率逐渐降低，但尚未完....

图3非度量多维标度（NMDS）图

图2稀释曲线和Rank-abundance曲线2.3敏感品系与抗性种群肠道菌群的种类组成及相对丰度

图4敏感品系与抗性种群肠道菌群相对丰度

在目分类阶元水平上（图4B），敏感品系中肠道菌群相对丰度最高的前3位依次为红螺菌目（Rhodospirillales）、肠杆菌目（Enterobacteriles）及伯克霍尔德氏菌目（Burkholderiales），其相对丰度分别为（65.92±8.94）%、（3.20±1.1....

本文编号：3997305