细粒棘球绦虫肌动蛋白抗原表位预测

发布时间：2021-06-28 09:21

　　目的对细粒棘球绦虫肌动蛋白（Echinococcus granulosus actin EgACT）的结构和抗原表位进行分析,为筛选疫苗候选抗原提供依据。方法采用生物信息学技术分析EgACT的理化性质和亲/疏水性、柔性区域、抗原指数、表面可及性、可能的信号肽序列、跨膜结构区域、二级结构及优势抗原表位。结果细粒棘球绦虫肌动蛋白由376个氨基酸组成,相对分子质量为41.95 k Da,等电点理论值为5.38,不稳定系数为39.28（稳定蛋白）;亲水区域明显;柔性区域呈散在分布,较明显的分布区域位于12-30、37-42、57-63、79-85、107-118、195-208、232-240、282-293、312-319、360-368氨基酸区段;表面可及性得分较高的区域主要位于58-63、78-86、109-119、231-244、286-294、312-318、359-365氨基酸区段;抗原性指数得分较高区域与柔性区域的分布一致;无信号肽序列;无跨膜区;二级结构中的β转角占6.65%、α螺旋占37.5%、延伸链占21.28%、无规则卷曲占34.57%,优势B细胞表位位于14-29、52... 

【文章来源】：中国高原医学与生物学杂志. 2020,41(02)

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【部分图文】：

Eg ACT二级结构预测结果图

Swiss model网站构建的Eg ACT三级结构图

如图3所示，综合Expasy和DNAstar Protean软件分析结果，该蛋白可明显看到分布较多的亲水性区域，位于21-30、50-67、70-92、95-106、109-121、191-216、222-246、283-295、311-321、331-340、355-346氨基酸区段，这些区域暴露于蛋白表面，易于形成抗原表位。如图4所示，柔性区域呈散在分布，较明显的分布区域位于12-30、37-42、57-63、79-85、107-118、195-208、232-240、282-293、312-319、360-368氨基酸区段。表面可及性得分较高的区域主要位于58-63、78-86、109-119、231-244、286-294、312-318、359-365氨基酸区段。抗原性指数得分较高区域与柔性区域的分布一致。

【参考文献】：
期刊论文
[1]棘球蚴(包虫)病疫苗研究进展[J]. 朱国强,闫鸿斌,李立,贾万忠.  中国人兽共患病学报. 2019(01)



本文编号：3254050