利用遗传多样性小鼠资源筛选CA16致病相关基因

发布时间：2021-07-17 14:40

　　目的柯萨奇病毒A16型（Coxsachievirus A16,CA16）是手足口病主要致病病原体之一,其致病机制尚未明确。本研究利用遗传多样性小鼠（Genetic Diversity Mice）筛选CA16致病相关基因,深入研究该病毒的致病机制。方法选取23个遗传多样性小鼠品系为实验组,近交系C57BL/6小鼠为阴性对照组,均经腹腔感染107Copies CA16病毒,取材血液和后肢骨骼肌样本,利用实时荧光定量PCR测定样本的病毒载量,之后利用The Gene Mine系统遗传学数据库分析感染数据,筛选获得CA16致病相关基因。结果依据感染小鼠血液和肌肉中病毒拷贝数均高于104Copies/（μL/mg）的筛选标准,得到7个对CA16易感的遗传多样性小鼠品系,且这些小鼠的骨骼肌组织表现出显著的病理损伤;同时基于The Gene Mine专业数据库的相应数据分析,发现小鼠3号及4号染色体与CA16致病最为相关,并最终筛选到16个可能与CA16致病相关的基因。结论遗传多样性小鼠资源为CA16致病相关基因研究提供新思路。 

【文章来源】：中国实验动物学报. 2020,28(02)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

不同品系遗传多样性小鼠感染CA16血液及骨骼肌病毒载量

图1 不同品系遗传多样性小鼠感染CA16血液及骨骼肌病毒载量与此同时，The Gene Mine数据库给出了16个与CA16病毒感染相关基因(表2)。经过生物学功能分类，发现:转运相关基因5个，分别为Slc22a15、Casq2、Dennd2c、Syt6和Atp1a1，其功能主要与钠钾钙离子转运相关;细胞生长相关基因4个，分别为Sycp1、Bcas2、Ngf和Mab21l3;免疫相关基因2个，为白细胞分化抗原Cd2和黏附因子Igsf3，二者均为重要的免疫细胞表面功能分子，在机体对外界病毒感染进行免疫应答反应过程中发挥重要作用;转录调控相关基因2个，为Csde1、Nr1h5;代谢相关基因2个，为Dpyd、Ampd1;癌症相关基因tusc1。

综上所述，利用The Gene Mine数据库进行数据分析发现CA16致病相关主效应基因集中于小鼠3号及4号染色体，并从中筛选出16个候选基因，为后续CA16致病机制研究提供基础。3 讨论

【参考文献】：
期刊论文
[1]通过遗传多样性小鼠筛选EV71致病相关基因[J]. 陈鑫,赵彬彬,武婧,彭婉君,牛栋,韩云林,王欣佩,张伶燕,刘江宁.  中国比较医学杂志. 2019(06)
[2]EV71和CA16型手足口病动物模型及其病毒感染特点分析[J]. 姚荣妹,毛鑫,曲天歌,郭姗姗,包蕾,鮑岩岩,崔晓兰.  中国实验方剂学杂志. 2019(08)
[3]复杂性状遗传CC小鼠与精准医学研究[J]. 杜朋,陈孟毅,李程程,樊飞跃,孟爱民.  中国比较医学杂志. 2016(08)
[4]复杂性状遗传CC小鼠——肿瘤研究新平台[J]. 李克娟,高苒.  中国比较医学杂志. 2016(08)
[5]复杂性状遗传CC小鼠信息资源及研究应用[J]. 孔琪,夏霞宇,秦川.  中国比较医学杂志. 2016(07)
[6]2008—2011年我国大陆地区重症手足口病流行特征分析[J]. 杨芳,于石成,张菊英,肖革新,马家奇.  疾病监测. 2013(11)



本文编号：3288368