HPV16/18E6/E7蛋白抗原表位理论预测与分子模拟研究
发布时间:2021-08-09 06:24
目的人乳头瘤病毒(HPV)与全球约4.5%的癌症密切相关,与几乎所有宫颈癌相关,其中HPV16和HPV18约占70%。方法鉴于E6/E7蛋白是维持HPV阳性癌细胞恶性表型的关键因素,是开发治疗性HPV疫苗的潜在靶标,通过分子模拟理论预测潜在抗原表位可以为疫苗开发提供理论指导。结果本研究利用在线工具预测HPV16、HPV18 E6/E7蛋白的潜在抗原表位,通过分子动力学模拟获得表位与MHC结合的稳定构象,结合自由能计算结果显示表位KLPDLCTEL(-31.02 kcal/mol)、TLQQDIVLHL(-31.33 kcal/mol)、YMLDLQPET(-34.09 kcal/mol)与HLA-A*0201具有潜在结合能力。结论通过分析表位与MHC结合模式,为表位的改造与HPV治疗性疫苗研究提供了理论线索。
【文章来源】:免疫学杂志. 2020,36(08)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
MHC/表位复合物RMSD图
在线预测的抗原表位中,YMLDLQPET(PDBID:6E1I)和LLMGTLGIV(PDBID:6APN,结合表位为LLMGTLGIVGGG)与HLA-A*0201的晶体结构已经报道(研究论文暂未公开发表),本研究则以表位YMLDLQPET为对照,通过分子分子动力学模拟获得抗原表位与MHC结合的稳定结构,表位与HLA-A*0201的结合自由能显示,尽管表位TLQDIVLHL在线预测的亲和力较差,但结合亲和力更强,有利于与HLA-A*0201的结合。图3 表位与MHC相互作用
图2 表位各氨基酸的结合自由能分解基于分子动力学模拟获得的MHC/表位复合物稳定结构,本研究系统分析了表位与MHC结合的构象变化、氢键数量、表位氨基酸的结合能贡献,为抗原表位的改造提供了理论依据。同时,通过分析MHC/表位复合物的空间结构,能够推测其与TCR结合的可能性,为表位筛选提供更多信息。
【参考文献】:
期刊论文
[1]HPV 18型E6蛋白抗原表位预测与分析[J]. 苏琳,张祥,李泳榆,刘思静,蒋明娟,汪川. 现代预防医学. 2018(07)
[2]HPV逃避宫颈癌宿主免疫应答的机制[J]. 唐隽,郝飞. 免疫学杂志. 2011(07)
[3]HPV18E7抗原HLA-A2限制性CTL表位的初步筛选[J]. 张乾,郑飞云,徐云升,欧荣英,余剑琴. 温州医学院学报. 2007(02)
[4]HPV16E7抗原HLA-A2限制性CTL表位预测及其合成[J]. 徐云升,郝飞,吴玉章,林治华,贾正才,郝进. 免疫学杂志. 2003(02)
本文编号:3331552
【文章来源】:免疫学杂志. 2020,36(08)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
MHC/表位复合物RMSD图
在线预测的抗原表位中,YMLDLQPET(PDBID:6E1I)和LLMGTLGIV(PDBID:6APN,结合表位为LLMGTLGIVGGG)与HLA-A*0201的晶体结构已经报道(研究论文暂未公开发表),本研究则以表位YMLDLQPET为对照,通过分子分子动力学模拟获得抗原表位与MHC结合的稳定结构,表位与HLA-A*0201的结合自由能显示,尽管表位TLQDIVLHL在线预测的亲和力较差,但结合亲和力更强,有利于与HLA-A*0201的结合。图3 表位与MHC相互作用
图2 表位各氨基酸的结合自由能分解基于分子动力学模拟获得的MHC/表位复合物稳定结构,本研究系统分析了表位与MHC结合的构象变化、氢键数量、表位氨基酸的结合能贡献,为抗原表位的改造提供了理论依据。同时,通过分析MHC/表位复合物的空间结构,能够推测其与TCR结合的可能性,为表位筛选提供更多信息。
【参考文献】:
期刊论文
[1]HPV 18型E6蛋白抗原表位预测与分析[J]. 苏琳,张祥,李泳榆,刘思静,蒋明娟,汪川. 现代预防医学. 2018(07)
[2]HPV逃避宫颈癌宿主免疫应答的机制[J]. 唐隽,郝飞. 免疫学杂志. 2011(07)
[3]HPV18E7抗原HLA-A2限制性CTL表位的初步筛选[J]. 张乾,郑飞云,徐云升,欧荣英,余剑琴. 温州医学院学报. 2007(02)
[4]HPV16E7抗原HLA-A2限制性CTL表位预测及其合成[J]. 徐云升,郝飞,吴玉章,林治华,贾正才,郝进. 免疫学杂志. 2003(02)
本文编号:3331552
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/jichuyixue/3331552.html
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