无形体分泌蛋白Ats-1与宿主细胞互作蛋白筛选及其生物信息分析
发布时间:2021-09-17 14:19
目的筛选与无形体Ats-1互作的THP-1宿主细胞蛋白,为揭示病原体侵袭宿主的致病机理提供科学数据。方法利用分子克隆法构建p GBKT7-ats-1诱饵质粒并转化酵母Y2HGold,验证诱饵质粒是否有自激活、毒性现象;制备THP-1细胞c DNA并连接到p GADT7-Rec上,转化酵母Y187并鉴定c DNA文库质量;酵母双杂交筛选与Ats-1互作的宿主细胞靶蛋白,通过GO、String生物信息分析细胞靶蛋白可能的生物学过程。结果成功构建诱饵质粒;cDNA文库容量4×106克隆,插入片段100~3 000 bp,且无污染,达到建库质控要求;酵母双杂交结果显示,与Ats-1蛋白互作的宿主细胞靶蛋白7个,分别是真核延伸因子1复合体α1亚基(EEF1A1)、TIMP金属蛋白酶抑制子1(TIMP1)、锌指蛋白36,C3H样2 (ZFP36L2)、半乳糖凝集素1(LGALS1)、前胸腺素α(PTMA)、WBSCR22、吸引素(ATRN)。生物信息分析显示,与Ats-1互作的宿主靶蛋白主要参与细胞分化增殖、细胞凋亡、自噬、炎症等生物学过程。结论病原诱饵蛋白与宿主细胞靶蛋白互...
【文章来源】:石河子大学学报(自然科学版). 2020,38(02)北大核心
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
目的基因ats-1的PCR扩增
Ats-1蛋白质三级结构预测
Ats-1蛋白质无形体内互作网络图
本文编号:3398901
【文章来源】:石河子大学学报(自然科学版). 2020,38(02)北大核心
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
目的基因ats-1的PCR扩增
Ats-1蛋白质三级结构预测
Ats-1蛋白质无形体内互作网络图
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