东南亚十二节段双链RNA病毒的分子进化及基因组结构特征分析

发布时间：2022-02-11 06:56

　　目的了解东南亚十二节段双链RNA病毒（South-East Asian dodeca RNA viruses,Seadornavirus）的分子进化规律及遗传差异。方法基于Seadornavirus衣壳蛋白基因组序列进行同源性、系统进化、理化性质、抗原表位预测以及三级结构和表面电荷分布的分析。结果 Seadornavirus的最近共同祖先大约于2 359年前,分为3个进化簇,其进化时间分别为约距今1 338、499、253年前,其平均核苷酸替换率为3.6×10-4n/s/y。Seadornavirus 3种病毒之间的核苷酸与氨基酸同源性分别是31.3%～100%（μ=68.0%）和11.9%～100%（μ=56.0%）。理化性质和抗原表位分析显示,版纳病毒（Banna virus, BAV）衣壳蛋白为酸性疏水性蛋白质,存在6个B细胞表位和2个Th抗原表位,而辽宁病毒（Liaoning virus, LNV）和卡迪皮诺病毒（Kadipiro virus, KDV）为碱性亲水性蛋白质,分别存在3和5个B细胞抗原表位,其中LNV仅有1个Th抗原表位,KDV病毒则不存在。三级结构以及蛋白表面电... 

【文章来源】：中华实验和临床病毒学杂志. 2020,34(03)CSCD

【文章页数】：8 页

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3619816