EB病毒gp350/220抗原T-B联合表位生物信息学预测

发布时间：2022-02-16 23:37

　　为预测EB病毒（EBV）gp350/220抗原T-B联合表位,采用在线软件IEDB和SYFPEITHIT分别预测gp350/220抗原B细胞表位和T细胞表位,寻找该抗原B细胞和T细胞共同的区域即T-B联合表位。gp350/220抗原存在潜在的T-B联合表位区域:28-43、49-55、59-64、69-79、85-91、99-111、119-129、135-144。本文运用生物信息学方法确定了gp350/220分别存在5个T细胞抗原表位﹑6个B细胞表位和3个T-B细胞联合表位区域,为进一步研发gp350/220高价优势表位疫苗奠定基础。 

【文章来源】：中南医学科学杂志. 2020,48(03)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 EBV gp350/220氨基酸序列
    1.2 gp350/220氨基酸序列跨膜序列的分析
    1.3 gp350/220抗原二级结构预测
    1.4 gp350/220抗原B细胞和T细胞表位预测
    1.5 EBV gp350/220抗原T-B联合表位的筛选
2 结 果
    2.1 查找Gen bank EBV gp350/220抗原的氨基酸序列
    2.2 运用TMHMM Sever2.0对gp350/220的跨膜序列进行分析
    2.3 gp350/220抗原蛋白质二级结构预测
    2.4 T细胞表位预测结果
    2.5 运用DNAman软件中的多重序列对比T、B细胞表位
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]携带EBV-LMP1Δ基因的DNA疫苗和腺病毒疫苗联合免疫效果研究[J]. 尉秀霞,王湛,周玲,杜海军,叶树清,曾毅.  中国病毒病杂志. 2012(04)
[2]GPⅡb/Ⅲa抗体的二级结构及T、B细胞表位的预测[J]. 李章球,张梅霞,胡海燕,刘顺会,陆志刚.  生物医学工程学杂志. 2010(05)
[3]FSHR胞外区抗原的二级结构预测和B细胞表位预测[J]. 申子刚,阎萍,何畏,陈正琼,何海洋,张记,杨霞,吴玉章,梁志清,李晋涛.  重庆医科大学学报. 2010(09)
[4]EB病毒潜伏膜蛋白2的B细胞表位免疫原性研究[J]. 李文姝,郑美霞,欧琴,朱珊丽,张丽芳.  中华传染病杂志. 2010 (10)



本文编号：3628872