基于元分析的结核分枝杆菌感染巨噬细胞免疫应答关键基因的挖掘及验证

发布时间：2022-07-19 14:19

　　研究背景及目的结核病（TB）是由结核分枝杆菌（M.tb）感染引起的一种传染病,是全球十大死因之一,也是单一病原体感染造成死亡的主要原因,甚至超过了艾滋病。巨噬细胞作为免疫系统的基石,是先天性免疫的的重要组成部分,能够摄取和降解衰老的细胞和微生物等异物,协调炎症过程,成为宿主抵御M.tb的第一道防线。但是细胞分枝杆菌学的最新进展表明,M.tb使用复杂的策略来破坏巨噬细胞功能,以抵御宿主的先天性免疫清除作用,从而实现免疫逃逸。随着微阵列技术的普及,很多公共平台上提供了各种与生理和疾病状况相关的基因表达数据。元分析能够在严格的设计基础上,对同一受试者的多项独立研究结果进行系统和定量的综合分析,极大的提高基因表达数据分析的统计学意义及可信度。本研究应用元分析技术对结核分枝杆菌H37Rv感染THP-1源性巨噬细胞表达谱芯片进行整合分析,高通量筛选巨噬细胞免疫应答关键基因,为进一步探索结核分枝杆菌感染的免疫应答机制提供参考,同时为结核病特效新药的研发奠定基础。材料及方法通过GEO Datasets数据库搜集获得结核分枝杆菌H37Rv感染人急性粒细胞白血病单核细胞THP-1源性巨噬细胞模型的表达谱芯... 

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
abstract
英文缩写词表
第一章 绪论
    1 结核病的概述
        1.1 结核病与结核分枝杆菌
        1.2 结核病的发病机制
        1.3 巨噬细胞在结核病中的作用
        1.4 结核分枝杆菌对抗巨噬细胞的策略
    2 结核病相关的芯片数据研究的主要内容
        2.1 生物信息学
        2.2 基因芯片技术
        2.3 基因芯片数据分析工具和方法
        2.4 基因芯片技术在结核病领域的应用
第二章 结核分枝杆菌H37Rv感染THP-1 源性巨噬细胞模型数据的收集与分析
    1 材料与方法
        1.1 基因芯片数据检索
        1.2 基因芯片数据元分析
        1.3 聚类分析
        1.4 蛋白互作网络分析
        1.5 通路富集分析
    2 数据分析结果
        2.1 基因芯片数据的提取结果
        2.2 基因芯片数据的元分析结果
        2.3 聚类分析
        2.4 蛋白互作网络
        2.5 通路富集分析
第三章 结核分枝杆菌感染THP-1源性巨噬细胞的细胞实验模型的建立及研究
    1 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 实验方法
    2 实验结果
        2.1 细胞实验模型
        2.2 总RNA提取与鉴定
        2.3 巨噬细胞OASL基因shRNA敲减实验
第四章 讨论
第五章 结论
参考文献
附录
作者简介
致谢



本文编号：3663570