红色毛癣菌（Trichophyton rubrum）miRNA及其对孢子和菌丝中基因表达调控分析

发布时间：2022-10-20 13:22

　　microRNA（miRNA）是真核生物中存在的一类小分子RNA,通常为18-24nt,广泛参与基因表达的调控。红色毛癣菌是重要的病原真菌,也是浅表感染真菌研究的模式生物。本论文利用二代测序技术,通过构建红色毛癣菌孢子和菌丝的小RNA的文库,研究miRNA在红色毛癣菌中的存在情况,并对miRNA调控的靶基因进行预测;结合miRNA与对应的靶基因在孢子和菌丝中表达差异对miRNA参与红色毛癣菌基因表达及生长发育的调控进行初步研究。对红色毛癣菌孢子和菌丝中小RNA高通量测序发现了 158条保守的miRNAs和12条新发现的miRNAs。这些miRNA非常保守,属于92个miRNA家族（miRNA families）,在包括植物、动物等多个物种中都存在。对红色毛癣菌中miRNA调控的靶基因进行预测表明,170条miRNAs调控的靶基因为5470个。超过一半以上的靶基因对应2个或2个以上的miRNAs,其中33条miRNAs调控100个以上的靶基因表达;12个靶基因对应8条miRNAs。这与一个miRNA可以调控多个（甚至上千个）基因表达;几个miRNAs也可以调节同一个基因表达的报道相一致。... 

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【学位级别】：硕士

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中文摘要
ABSTRACT
中英文对照表
第一章 引言
    一、miRNA介绍
        1.1 miRNA的发现
        1.2 miRNA合成及生物学特征
        1.3 miRNA的作用机制
        1.4 miRNA的生物学功能
        1.5 miRNA检测技术
        1.6 miRNA生物信息学分析
        1.7 真菌中miRNA研究进展
    二、红色毛癣菌研究
    三、立项依据
第二章 实验材料与方法
    2.1 实验材料
    2.2 实验方法
第三章 实验结果和讨论
    3.1 红色毛癣菌孢子和菌丝中miRNA的检测及特点分析
    3.2 红色毛癣菌中miRNA的鉴定及其特征分析
    3.3 红色毛癣菌中miRNA的靶基因预测及靶基因功能分析
    3.4 红色毛癣菌中的miRNA在其它表皮癣菌中的保守性
    3.5 红色毛癣中miRNA表达水平以及差异表达分析
    3.6 miRNA靶基因在孢子和菌丝中表达水平分析
    3.7 mRNA差异表达的关联分析
    3.8 miRNA和mRNA表达水平的RT-qPCR验证
    3.9 讨论
    3.10 总结
参考文献
附表
致谢



本文编号：3694594