肺炎克雷伯菌Hfq蛋白特性及对耐药的影响

发布时间：2023-04-01 05:29

　　Hfq(host factor for RNA phage QB replicase)蛋白是一个全局性调节因子,广泛参与细菌生长、趋化、毒力、耐药及应对外界选择压力等方面的调节,但在肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)中的功能尚不清楚。本研究从临床病例中分离到59株KP,将其hfq基因与11例常见临床感染菌株hfq基因[从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)数据库下载]进行了比较。所有hfq基因经EMBOSS Transeq翻译成氨基酸序列,用MAFFT软件进行多序列比对,并通过NCBI数据库中的保守结构域预测Hfq蛋白结构域。分别采用ESPript3.0、Phyre2分析Hfq蛋白的二、三级结构。59株KP中仅3株hfq基因的5个密码子位点存在差异,而其蛋白质氨基酸序列完全一致。KP与大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、痢疾志贺菌之间,Hfq蛋白的氨基酸序列相似度较高,主要区别在C末端上;与金黄色葡萄球菌、产单核细胞李斯特菌相比,KP Hfq蛋白在N末端和C末端上差别较大;所...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 菌株
        1.1.2 基因分析软件
        1.1.3 实验材料
    1.2 方法
        1.2.1 菌株hfq核酸序列分析
        1.2.2 Hfq氨基酸序列分析
        1.2.3 KP hfq基因的敲除
        1.2.4 菌株耐药性测定
        1.2.5 统计学方法
2 结果
    2.1 临床分离KP hfq基因密码子相对保守
    2.2 Hfq氨基酸理化性质
    2.3 Hfq蛋白序列C末端呈酸性
    2.4 KP Hfq蛋白RNA结合位点
    2.5 β4-β5区是Hfq蛋白的重要功能区域
    2.6 KP hfq基因敲除菌株的耐药能力下降
3 讨论



本文编号：3776529