中国部分地区猪胆汁戊型肝炎病毒基因型和中和抗原位点变异研究

发布时间：2023-04-29 21:29

　　目的调查猪胆汁戊型肝炎病毒(HEV)携带率、基因型和中和抗原位点变异。方法在中国4个地区屠宰场采集成年商品猪的胆汁标本,采用real-time RT-PCR检测HEV RNA;采用巢式RT-PCR扩增HEV ORF2区部分基因片段,进行基因分型和中和抗原位点氨基酸序列分析。结果猪胆汁标本HEV RNA总阳性率为8.6%(46/532),4个地区阳性率在3.0%-12.5%之间。19株HEV基因分型成功,均为基因4型,其中11株HEV基因亚型分型成功,均为4a亚型。在该11株HEV的21个中和抗原位点中,2株HEV在ORF2区分别发生第487位氨基酸突变(Ser487Tyr)和第564位氨基酸突变(Thr564Pro)。结论中国部分地区猪胆汁HEV携带率较高,为中国人群中优势流行的基因4型,且部分中和抗原位点发生突变;应加强猪群HEV的持续监测。

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【文章目录】：
材料与方法
    1猪胆汁标本采集
    2检测试剂盒
    3病毒核酸提取
    4 HEV R NA real time RT-PCR检测
    5巢式RT-PCR扩增
        5.1 HEV基因分型片段扩增
        5.2 HEV ORF2区部分基因序列扩增
    6序列分析
    7统计分析
结果
    1 HEV RNA检测阳性率
    2 HEV基因型
    3 HEV中和抗原位点变异
讨论



本文编号：3805777