Rv2462c蛋白基本特性及T细胞抗原表位分析

发布时间：2023-10-29 12:37

　　为进行结核分枝杆菌(MTB)Rv2462c蛋白的理化性质分析和T细胞的表位预测,首先在NCBI上查询Rv2462c蛋白的氨基酸序列,运用NCBI Blast对Rv2462c蛋白和人类蛋白进行同源性分析,用ExPASY(ProtParam)分析软件对Rv2462c蛋白进行理化性质分析,用Expasyde的Protscale程序对Rv2462c蛋白进行疏水性分析,用SignalP和TMHMM软件对Rv2462c蛋白进行信号肽和跨膜区预测分析;NetMHCⅡpan3.2Server软件预测Rv2462c蛋白的CD4⁺T细胞表位的分布情况;分别用NetMHC、NetCTL和SYFPEITHI三种分析软件预测Rv2462c蛋白的CD8⁺T细胞表位的分布情况,综合分析预测结果,最终筛选出T细胞优势表位。结果:综合CD4⁺T和CD8⁺T细胞表位预测结果,得到一条优势表位RLPGFRPGK_40-48。预测出的T细胞优势表位可以为结核病特异性诊断和结核病疫苗开发提供参考。

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【文章目录】：
1 引言
2 材料与方法
    2.1 材料
    2.2 方法
        2.2.1 同源性分析
        2.2.2 结核分枝杆菌Rv2462c蛋白的理化性质分析
        2.2.3 结核分枝杆菌Rv2462c蛋白结构分析
        2.2.4 CD4+ T细胞表位预测
        2.2.5 CD8+ T细胞表位预测
            (1)NetMHC的CD8+ T细胞表位预测。
            (2)NetCTL的CD8+ T细胞表位预测。
            (3)SYFPEITHI的CD8+ T细胞表位预测。
3 结果
    3.1 同源性分析结果
    3.2 结核分枝杆菌Rv2462c蛋白的理化性质分析结果
    3.3 结核分枝杆菌Rv2462c蛋白结构分析结果
    3.4 CD4+ T细胞表位预测结果
    3.5 CD8+ T细胞表位预测结果
    3.6 CD4+ T和CD8+ T细胞表位综合分析结果
4 结果



本文编号：3858093