小鼠侧脑室下区基因表达的增龄性变化研究

发布时间：2024-02-26 23:54

　　目的研究幼年期、成年期和老年期小鼠侧脑室下区(subventricular zone,SVZ)中基因表达的增龄性变化。方法分别提取3周龄、6月龄和20月龄C57小鼠SVZ的mRNA,基于转录组测序及实时荧光定量PCR技术,检测SVZ中在不同年龄阶段的基因表达差异。结果以幼年期小鼠为对照,成年期检测到253个差异表达的基因,老年期检测到519个,以成年期作对照,老年期检测到147个差异表达的基因。GO分析发现成年期小鼠与幼年期相比差异表达基因主要涉及营养和代谢,老年期小鼠与成年期相比主要涉及中枢神经系统神经元分化等。KEGG分析发现差异表达基因主要涉及通路为蛋白质消化吸收、神经活性配体-受体相互作用等。结论该研究提供了不同年龄段SVZ转录水平基因变化的数据,为探讨SVZ的功能发育和退化,进一步治疗和抵抗神经衰老提供新的理论依据和方法。

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【部分图文】：

图2差异基因表达Venn图

另外为了验证转录组测序结果的可信度，通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测差异表达基因的表达情况。如图4所示，qPCR检测的几个基因表达情况与转录组测序结果一致。图3幼年、成年与老年期小鼠神经干细胞差异表达基因统计

图3幼年、成年与老年期小鼠神经干细胞差异表达基因统计

图2差异基因表达Venn图2.2GO分析

图4差异基因表达qPCR验证

利用clusterProfilerR软件对差异基因进行KEGG通路分析(图6)。成年期与幼年期小鼠的SVZ比较，差异表达基因涉及蛋白质消化吸收的信号通路。老年期与幼年期小鼠的SVZ比较，涉及信号通路较多，包括神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、吗啡成瘾、多巴胺能突....

图5GO功能分类

本研究对小鼠幼年、成年和老年期SVZ的cDNA文库进行分析，幼年与成年期或老年期小鼠对比，共检测到253个及519个差异表达的基因;成年与老年期小鼠对比，共检测到147个差异表达的基因。意料之中的是，由于小鼠从幼年到老年发育时间跨度较长，差异表达的基因数目最多。小鼠作为经典的模式....

本文编号：3912052