新型冠状病毒复制依赖基因MTHFD1的表达及功能

发布时间：2024-03-15 19:57

　　【目的】研究新型冠状病毒(SARS-CoV-2)复制依赖基因MTHFD1在人群间的功能差异以及该基因与病毒蛋白的相互作用关系。【方法】使用千人基因组计划和gnomAD数据库,系统分析MTHFD1基因的重要功能变异(包括有害错义变异和eQTL变异)在世界不同人群间的分布。并进一步通过蛋白互作数据库STRING和IntAct,以及手工文献检索,寻找与MTHFD1蛋白有相互作用的其他蛋白。【结果】MTHFD1基因上有419个错义突变,其中有害变异195个;大部分的有害变异都是低频的,唯一的例外是变异位点rs10813,它在全世界总人群中等位基因频率大于0.01且该位点在物种间具有保守性。此外,在肺组织中发现了1个MTHFD1基因的eQTL变异(rs57087457),该位点在东亚人群中具有更低的等位基因频率,说明在东亚人群中MTHFD1基因可能具有较高表达水平。通过蛋白相互作用研究,发现GGH,ACSL3,MAT2B,ARF6,CUL2,BRD4等6个蛋白与MTHFD1蛋白存在蛋白互作。【结论】在不同人群中,MTHFD1存在天然抗性变异,这些变异的等位基因频率在人群间存在差异,可能对新型冠状...

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 MTHFD1基因在人体各组织中的表达
    1.2 MTHFD1基因eQTL的人群分布
    1.3 MTHFD1基因错义突变的人群分布
    1.4 MTHFD1基因编码的蛋白与新型冠状病毒蛋白的互作研究
2 结果
    2.1 MTHFD1基因在人体各组织中的表达
    2.2 eQTL的人群分布
    2.3 MTHFD1基因错义突变的人群分布
    2.4 MTHFD1基因编码蛋白与新型冠状病毒蛋白的相互作用
3 讨论



本文编号：3928793