2014―2019年青岛市A型流感病毒进化分析
发布时间:2024-04-21 09:20
目的了解2014―2019年青岛市人群A型流感病毒(influenza A virus,IAV)流行病学和遗传特征。方法提取9 807份流感样病例咽拭子标本的病毒RNA,采用多重实时反转录PCR方法鉴定分型;采用一步法反转录PCR扩增IAV血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因,并进行序列测定和基因分析。结果 2014―2019年青岛市流感病毒流行具有北半球典型季节性流感特征。夏季小量流行主要是H3N2。青岛市IAV中H1N1pdm09和H3N2分别占57.6%和42.4%,并呈现交替流行。基因群分属于6B和3C。两者HA和NA基因进化都处在净化选择下,但抗原进化可能具有不同的进化模式。与2009年毒株相比,2019年青岛市H1N1pdm09和H3N2的HA分别已发生21个和30个氨基酸替换,均主要发生在头部,分别包含5个和18个抗原位点。H1N1pdm09检测到两株神经氨酸酶抑制剂抗性突变,1株为H275Y突变,另1株为S247N突变;H3N2中未发现NAI抗性突变。结论 H1N1pdm09和H3N2是2014―2019年青岛市...
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 标本资料
1.2 核酸提取
1.3 流感病毒鉴定
1.4 基因扩增
1.5 序列分析
2 结果
2.1 流感病毒时间分布
2.2 基因进化
2.3 氨基酸变异分析
3 讨论
本文编号:3960704
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1 材料与方法
1.1 标本资料
1.2 核酸提取
1.3 流感病毒鉴定
1.4 基因扩增
1.5 序列分析
2 结果
2.1 流感病毒时间分布
2.2 基因进化
2.3 氨基酸变异分析
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