湖北肠道病毒EV71型流行株VP1基因以及蛋白结构特征分析

发布时间：2017-08-02 11:40

  本文关键词：湖北肠道病毒EV71型流行株VP1基因以及蛋白结构特征分析

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【摘要】：目的全面研究和了解2011年湖北省肠道病毒71型的VP1基因及蛋白结构特征,分析EV71型病毒在湖北省的基因型别,探讨该型病毒在全省的地理分布特征。方法对2011年湖北省8个区市的20株EV71流行株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸序列进行同源性比较及系统进化分析,并对VP1蛋白序列的亲水性、柔韧性等二级和三级结构进行分析。结果 2011年湖北省EV71型流行株的基因亚型为C4a亚型,其VP1区核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性较高,分别为96.5%~98.7%和98.3%~100%。VP1蛋白特征分析发现该区主要免疫表位均没有发生变异且存在较多亲水性区域。二级结构以无规则卷曲为主,其次为β片层。蛋白质同源建模未发现不同毒株间VP1蛋白三级结构差别。结论 2011年湖北省EV71型流行株与我国其它地区的毒株有较高同源性,且存在一定的地理区域聚集性特征和遗传多样性特点。同时综合多种方法预测EV71VP1的二级结构和三级结构,为进一步研究开发相关药品和防治EV71感染提供理论基础。
【作者单位】： 湖北省疾病预防控制中心;
【关键词】： 肠道病毒型 VP区 基因特征
【分类号】：R373
【正文快照】： 肠道病毒71(Enterovirus 71,EV71)为小RNA病毒科(Picornaradae)肠道病毒属(Enterovirus)人类肠道病毒A型(human enterovirus A species)成员[1]。EV7l感染可引起多种临床症状,除手足口病 外,还能引起发热性疾病、疱疹性咽峡炎、无菌性脑膜炎、脑干脑炎和脊髓灰质炎样的麻痹等

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 董晓楠;应剑;陈应华;;1970～2004年全球肠道病毒71型分离株的分子流行病学分析[J];科学通报;2007年09期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 杨敏;都鹏飞;;小儿手足口病病原体研究进展[J];安徽医学;2011年03期

2 罗明鑫;李晓红;潘家华;何金根;陈云龙;;手足口病并发脑脊髓炎2例[J];安徽医药;2009年10期

3 姚英民;谢健屏;赖桂香;方焕生;;广州地区儿童肠道病毒71型分离与鉴定[J];南方医科大学学报;2008年10期

4 陈庆会;;肠道病毒71型致手足口病合并脑炎81例临床分析[J];中国感染控制杂志;2011年05期

5 陈敏玫;谭毅;莫兆军;周开姣;闭福银;康宁;刘巍;杨进业;;肠道病毒71型广西株的种系进化分析[J];应用预防医学;2008年06期

6 蒋玉艳;班华国;马宇燕;韦一知;黄林;钟革;;急性弛缓性麻痹病例中EV71感染的初步探讨[J];应用预防医学;2010年06期

7 杨跃杰;任英杰;姚雪花;杨晓霞;张丽淑;张文忠;;重症手足口病164例脑脊液分析[J];临床医学;2012年09期

8 方柯南;;锥体外系反应误诊手足口病重症分析[J];临床医学;2012年12期

9 卢联合;陈志海;徐艳利;宋蕊;王爱彬;李兴旺;;儿童重型及危重型手足口病临床特征的研究[J];中国医药导刊;2013年04期

10 郭振平;;邢台市手足口病重症病例流行特征分析[J];河北医药;2009年22期

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 吴斌;闫强;汤奋扬;李亮;徐飞海;葛胜祥;崔仑标;王慎骄;付建光;田华;秦圆方;邓斐;祁贤;朱凤才;羊海涛;汪华;;江苏省肠道病毒71型分离株的分子遗传进化特征[A];华东地区第十次流行病学学术会议暨华东地区流行病学学术会议20周年庆典论文汇编[C];2010年

中国博士学位论文全文数据库 前2条

1 茅凌翔;肠道病毒71型分子流行病学调查及miRNA抑制肠道病毒71型体外复制的研究[D];江苏大学;2011年

2 罗文英;肠道病毒71型感染人脑微血管内皮细胞的机制研究[D];南方医科大学;2012年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 雷红娟;肠道病毒71型H6株在Vero细胞上的传代适应[D];河南师范大学;2010年

2 杨永华;肠道病毒71型的层析纯化[D];河南师范大学;2011年

3 杨全中;肠道病毒71型的检测及初步纯化[D];河南师范大学;2011年

4 檀晓娟;2007年山东省手足口病暴发的病因学研究[D];中国疾病预防控制中心;2008年

5 刘云霞;EV71不同毒株在不同温度条件下的增殖动力学研究[D];昆明医学院;2010年

6 戈小琴;肠道病毒71型VP1-VP4在重组腺病毒系统中的表达及免疫学评价[D];中国协和医科大学;2010年

7 李鹏;307例重症手足口病患儿脑脊液中蛋白质及NSE含量的动态变化[D];河北医科大学;2010年

8 李岩;河北省致手足口病病原谱及病原基因特征分析[D];河北医科大学;2010年

9 刘娟;抗EV71病毒药物靶标的筛选与验证[D];北京工业大学;2012年

10 牛文柯;2007～2011年山东省手足口病流行特征及死亡危险因素分析[D];山东大学;2012年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 崔爱利,许文波,李秀珠,胡家瑜,凌华,唐伟,杨智宏,张燕,陈立,Hiroyuki Shimizu;肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征[J];病毒学报;2004年02期

2 杨智宏,朱启昒,李秀珠,王晓红,王建设,胡家瑜,唐伟,崔爱利;2002年上海儿童手足口病病例中肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型的调查[J];中华儿科杂志;2005年09期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 李薇;李建强;赵祖波;王智永;赵英杰;王玉琳;;肠道病毒71型甘肃分离株VP1基因特征分析[J];中国生物制品学杂志;2010年10期

2 王世富;张乐海;马丽霞;刘霞;姜忠强;于华凤;;山东省部分地区肠道病毒71型的RT-PCR检测及基因特征分析[J];中国病原生物学杂志;2009年12期

3 许松涛;姬奕昕;朱贞;关蓉晖;蒋小泓;张燕;刘中华;崔爱利;毛乃颖;梁勇;周淑洁;张杰;李崇山;许文波;;中国2005年流行麻疹野病毒H_(1a)基因亚型血凝素基因和氨基酸特征分析[J];中国计划免疫;2006年01期

4 傅燕;董红军;倪红霞;胡逢蛟;;宁波地区2004年-2009年麻疹病毒分离株血溶素蛋白基因特征分析[J];中国卫生检验杂志;2011年05期

5 赵蕴杰;龚洲;肖奕;;基于二级结构的RNA三级结构预测[J];生物物理学报;2009年S1期

6 吴玉章,朱锡华;Pre-S2蛋白抗原表位及二级结构的预测与比较[J];免疫学杂志;1993年01期

7 吴晓明,王波,程敬之;基于小波分析法的蛋白质结构研究[J];西安交通大学学报;2002年04期

8 侯祥;周剑惠;常新;王爽;陈超;刘桂艳;齐中;吴丹;安小娜;浦苗;张勇;;吉林省2009年致手足口病流行的肠道病毒71型分离株基因特征分析[J];中国疫苗和免疫;2011年03期

9 T3玉章,朱锡华;不同亚型乙肝病毒Pre-S(2)蛋白二级结构及抗原表位的预测与比较[J];中国生物化学与分子生物学报;1993年02期

10 毛华伟;赵晓东;杨锡强;;人偏肺病毒黏附蛋白的二级结构及B细胞表位初步预测[J];中华微生物学和免疫学杂志;2005年12期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 刘卫东;庞玉玺;刘爱琢;裴奉奎;;眼镜王蛇神经毒素(CM-11)的一级序列、二级结构和三级结构的确定[A];第九届全国波谱学学术会议论文摘要集[C];1996年

2 龚黎明;葛琼;严菊英;卢亦愚;冯燕;茅海燕;李敏红;周敏;;浙江省肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析[A];应对突发公共卫生事件论坛论文集[C];2005年

3 赵武;李斌;梁家幸;梁保忠;姚瑞英;黄安国;何颖;蒋玉雯;;猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)VP1蛋白二级结构及B细胞抗原表位预测[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（上册）[C];2009年

4 邱阳;林克椿;聂松青;;HIV-1gp41N端融合肽及其突变体与脂膜作用后二级结构的变化[A];第七届全国生物膜学术讨论会论文摘要汇编[C];1999年

5 ;湖北省暨武汉市生物化学与分子生物学学会第八届理事会候选人简介[A];湖北省暨武汉生物化学与分子生物学学会第八届会员代表大会和第十五次学术年会论文摘要汇编[C];2004年

6 彭丹;刘胜祥;田春元;;湖北省的苔藓植物资源 Ⅷ.后河国家级自然保护区藓类植物区系的初步研究[A];中国植物学会七十周年年会论文摘要汇编（1933—2003）[C];2003年

7 刘胜祥;田春元;王长力;郑桂灵;陈桂英;陈妞;;湖北省的苔藓植物资源 Ⅶ.九宫山藓类植物区系的初步研究[A];中国植物学会七十周年年会论文摘要汇编（1933—2003）[C];2003年

8 黄金海;杨汉春;郭鑫;陈艳红;韩军;;PRRSV GP5蛋白的高效表达、纯化与结构分析[A];中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第六次研讨会论文集[C];2005年

9 吴斌;闫强;汤奋扬;李亮;徐飞海;葛胜祥;崔仑标;王慎骄;付建光;田华;秦圆方;邓斐;祁贤;朱凤才;羊海涛;汪华;;江苏省肠道病毒71型分离株的分子遗传进化特征[A];华东地区第十次流行病学学术会议暨华东地区流行病学学术会议20周年庆典论文汇编[C];2010年

10 陆锡锋;杨旭日;翁建全;徐灵均;周瑛;;圆二色光谱法研究Se形态与牛血清蛋白的相互作用[A];第十届中国化学会分析化学年会暨第十届全国原子光谱学术会议论文摘要集[C];2009年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 石岩;对特色微生物基因进行系统研究[N];科技日报;2006年

2 沈，

本文编号：609122