人类多重剪接RNA结合蛋白类基因的克隆和分析
本文关键词:人类多重剪接RNA结合蛋白类基因的克隆和分析
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【摘要】:目的通过同源筛选的方法拼接并克隆人类多重剪接RNA结合蛋白2(RBPMS2)基因。方法采用同源筛选策略,以人RBPMS2基因作为信息探针,在GeneBank数据库中进行分析,将获得的高度同源的表达序列标签(EST)用VECTOR NTI软件拼接成重叠群。通过UCSCGenome Blat Server分析,确定RBPMS2基因的染色体定位,SMART网上分析工具进行结构域预测,Unigene数据库进行表达谱分析。结果电子克隆到人类RBPMS2新基因cDNA序列,含完整的开放阅读框(ORF)。RBPMS2基因编码的多肽由209个氨基酸组成,分子量22.5KDa,等电点8.63。SMART分析显示RBPMS2蛋白包含1个RNA识别模体(RRM)结构域。RBPMS2基因位于第15号染色体,定位在15q22.31,由7个外显子和6个内含子组成。电子表达谱分析显示RBPMS2在卵细胞、受精卵、囊胚、不同发育阶段的胚胎、膀胱、肾脏等组织中高表达。结论分析并克隆到了一个新的人类RBPMS2基因。
【作者单位】: 苏州卫生职业技术学院检验药学系;苏州大学医学部基础医学与生物科学学院生物化学与分子生物学教研室;
【关键词】: 多重剪接RNA结合蛋白 克隆
【分类号】:R346
【正文快照】: 电子克隆是近年来伴随着基因组计划和表达序列标签(EST)计划发展起来的一种有效的基因克隆新方法[1],主要原理是利用日益扩充的生物信息学数据库,借助电子计算机的巨大运算能力,依据相关生物学原理,将EST或基因组的序列组装和拼接,进一步利用RT-PCR方法快速克隆功能基因。随
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,本文编号:648830
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