华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征

发布时间：2017-09-08 04:23

  本文关键词：华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征

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【摘要】：目的评价VNTR-MIRU分型方法在结核病流行病学中的应用,并描述华东部分农村地区结核分枝杆菌的基因型分布及成簇特征。方法对浙江省宁波市鄞州区及江苏省盐城市阜宁县从2009年6月1日至2010年11月31日登记的结核病患者的结核分离菌株采用VNTR-MIRU方法进行分型,通过Hunter-Gaston指数(HGI)及遗传差异值(h)对MIRU位点进行分辨力及遗传差异性评价,同时进行问卷调查以收集患者的社会人口学及临床治疗信息。结果在297株结核杆菌分离株中发现了281种基因型,近期传播比例为5.4%,MIRU位点组合的分辨力(HGI)为0.9995,7个位点的分辨力大小依次为:VNTR3820Qub18Qub11aMIRU26Qub11bMtub21Qub26,位点的h大小排序与分辨力的大小排序相同,遗传差异性最大的位点为VNTR3820(h=0.8794),最小的为Qub26(h=0.6613)。比较两个研究地区的结核枝杆菌成簇特征,阜宁县菌株成簇率为19%,而鄞州区无菌株成簇,均呈现"唯一"基因型,这种差异的产生很可能与当地的人口迁徙有关。结论 7位点VNTR-MIRU分型法对结核枝杆菌进行分型简便快速,而且具有较高的分辨力,适合于结核的大规模快速检测。我国华东农村地区结核的流行以既往感染复燃为主,并存在一定比例的近期传播。
【作者单位】： 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室-公共卫生安全教育部重点实验室;江苏省盐城市阜宁县疾病预防控制中心;浙江省宁波市鄞州区疾病预防控制中心;
【关键词】： 结核分枝杆菌 VNTR-MIRU 基因分型 成簇
【基金】：国家自然科学基金项目(30800937) 教育部留学回国人员科研启动基金项目 上海市公共卫生重点学科建设计划(12GWZX0101)~~
【分类号】：R378.911
【正文快照】： 结核病是当今全球范围内对人类健康最具威胁的重大传染病,根据世界卫生组织的报告,中国是22个结核病高负担国家之一[1]。追踪传染源、阐明传播途径是防止结核病流行的研究重点[2],传统的流行病学方法并不能解决这两个问题,因此以基因分型技术为基础的分子流行病学在现在的研

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本文编号：811855