基于偏最小二乘线性判别分析的遗传算法在代谢组学特征筛选中的应用

发布时间：2017-10-04 04:24

  本文关键词：基于偏最小二乘线性判别分析的遗传算法在代谢组学特征筛选中的应用

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【摘要】：目的探讨基于偏最小二乘线性判别分析的遗传算法特征筛选性能,并将其应用于高维代谢组学数据。方法通过模拟试验验证基于偏最小二乘线性判别分析的遗传算法特征筛选能力,同时应用于卵巢良恶性肿瘤鉴别的代谢组学数据特征筛选分析。结果模拟实验显示,基于偏最小二乘线性判别分析的遗传算法对信息变量的筛选能力明显优于偏最小二乘变量投影重要性指标;代谢组学数据分析显示,使用遗传算法筛选出的变量能够获得更低的误差率,该方法筛得的变量具有更大的概率包含了与某种生物学结果相关的代谢物。结论基于偏最小二乘线性判别分析的遗传算法作为一种优化技术,在小样本条件下对高维数据的特征筛选具有较好的效果。
【作者单位】： 浙江省疾病预防控制中心;山东大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系;杭州师范大学医药卫生管理学院;哈尔滨医科大学卫生统计学教研室;
【关键词】： 偏最小二乘 判别分析 遗传算法 代谢组学
【基金】：国家自然科学基金资助(81172767)
【分类号】：R311;TP18
【正文快照】： 代谢组学通常使用理化分析技术对生物体体液或组织的小分子代谢物进行定量的动态测量,继而利用统计学方法识别与病理生理刺激或基因改变相关的代谢物,探索可能的代谢途径。基于分析技术的进步,如LC-MS,GC-MS和NMR,近年来代谢组学迅速发展,并成功地应用于医学、毒理学和营养学

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

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2 荀鹏程;钱国华;赵杨;于浩;陈峰;;高维生物学数据两阶段组合降维策略研究[J];中国卫生统计;2012年05期

【共引文献】

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中国博士学位论文全文数据库 前5条

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中国硕士学位论文全文数据库 前5条

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【二级参考文献】

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2 钱国华;荀鹏程;陈峰;于浩;;偏最小二乘法降维在微阵列数据判别分析中的应用[J];中国卫生统计;2007年02期

3 荀鹏程;钱国华;富春枫;于浩;陈峰;;判别分析驱动的微阵列数据的降维策略[J];中国卫生统计;2009年02期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

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中国重要会议论文全文数据库 前2条

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本文编号：968616