贵州省2009～2011年度新型H1N1流感病毒HA1基因序列分析

发布时间：2017-10-06 17:09

  本文关键词：贵州省2009～2011年度新型H1N1流感病毒HA1基因序列分析

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【摘要】：目的建立并完善贵州省新型甲型H1N1流感病毒基因分析检测技术平台,了解2009～2010年度贵州省新型H1N1流感病毒HA1片段与WHO公布的流行株是否有发生变异。方法收集10株新型H1N1流感病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带的大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,同源性及差异性分析,构建系统发育树。结果与古典猪流感病毒株相比,贵州省2009年、2010年、2011年流感病毒株同源性分别为72.0%～74.6%、72.0%、67.8%～68.3%。与其他4株亚洲株H1N1流感病毒代表株相比,贵州省2009年、2010年、2011年流感病毒株同源性分别为92.3%～95.8%、91.5%～92.4%、89.8%～90.8%。2009年度组内同源性为93.2%～100%;2010年组内高度同源,为100%;2011年组内同源性为98.3%。贵州省流感毒株与中俄代表株A/Habarovak/01/2009(H1N1)的HA1基因同属一个谱系,在同一个分支上,同时,与墨西哥第一株甲型H1N1流感A/MexioCity/001/2009(H1N1)亲缘关系也较近,在同一个大分支上。结论贵州省新型H1N1流感病毒代表株HA1基因与WHO公布的流行株在核苷酸水平有一定持续水平的变异。
【作者单位】： 贵州省疾病预防控制中心;
【关键词】： 贵州省 新型HN流感病毒 HA基因片段
【基金】：国家科技重大专项“传染病监测技术平台”项目 “云南及周边省市传染病病原谱流行规律研究”项目(2009ZX10602-12) 贵州省卫生厅课题资助(gzwkj2010-1-063)
【分类号】：R373
【正文快照】： 流感是由于人类感染流感病毒而发生的一种呼吸道传染病,具有较高的发病率和死亡率,人流感病毒份为甲(A)、乙(B)、丙(C)3个类型。对人类威胁最大的是甲型流感病毒,是引起季节性流感的主要病原体。根据病毒颗粒表面血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)蛋白

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 杨婵;;实时荧光逆转录聚合酶链反应对疑似甲型H1N1流感样本的检测结果及分析[J];检验医学与临床;2011年04期

2 杜颜彬;张晓莉;;甲型H1N1流感的流行特征及预防[J];社区医学杂志;2011年04期

3 龚甜;熊英;刘丽萍;王飞霞;施勇;周s，

本文编号：983962