精神分裂症患者血浆外泌体蛋白标志物的TMT定量蛋白质组学筛选及分析
发布时间:2020-08-18 15:09
【摘要】:目的:探讨首发精神分裂症患者及经药治疗精神患者血浆外泌体蛋白的表达变化,筛选并分析潜在的与精神分裂症患者的简便诊断及药物疗效监测等密切相关的生物学标志物。方法:采用串联质量标签标记技术(TMT)结合质谱技术对15例首发精神分裂症患者、42例经药治疗精神分裂症患者、45例健康体检者的血浆外泌体蛋白质进行检测,并进行蛋白质定量分析,筛选精神分裂症患者血浆外泌体中表达水平显著变化的差异蛋白。利用Max Quant软件、Uni Prot人类蛋白组SP数据库和在线工具String对差异蛋白进行生物信息学分析,查阅大量文献,筛选出候选的精神分裂症相关生物学标志物。利用平行反应监测(Parallel reaction monitoring,PRM)对筛选的候选蛋白标志物进行验证。结果:本研究共筛选出差异表达蛋白116种,首发精神分裂症组较健康体检组上调蛋白有92种,下调蛋白6种(P0.01);首发精神分裂症组较经药物治疗组上调蛋白有4个,下调蛋白22个(P0.01);经药物治疗组较健康体检组上调蛋白有共11个,下调蛋白15个(P0.01)。对差异蛋白进行GO基因注释分析,发现其主要参与15种生物学过程,主要来自16种细胞组成,主要具有16种分子功能;初步筛选出与精神分裂症相关的HP、SAP、ANP、CAM和PSMB7共5个候选蛋白标志物。三组之间的差异蛋白具有明显统计学,P0.01。通过PRM方法验证:HP和SAP的定量数据与TMT检测数据基本一致(P0.01),ANP则相反(P0.05)。结论:首发精神分裂症组与经药治疗精神分裂症组、健康体检者血浆外泌体蛋白质表达谱表现出一定差异,这些差异有可能成为精神分裂症患者简便诊断及药物疗效监测等的临床辅助性血浆外泌体蛋白标志物。
【学位授予单位】:遵义医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R749.3
【图文】:
图 1. 经药物治疗的精神分裂症患者与健康体检者的 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱3.2 外泌体电镜结果及 NTA 粒径分析结果3.2.1 外泌体的透射电镜实验结果本研究利用透射电镜观察到粒径在 30~150nm 左右、茶托状或凹陷半球形的外泌体样结构。
表 1. 三组样品的粒径分布及其相应浓度数据样品 首发组经药物治疗组 健康体检组平均粒径(nm) 168.7 140.3159.7粒径主峰(nm) 106.9 122.1151.0总浓度(1×1010particle ml-1)4.39 5.54 4.96粒径 30nm -150nm 百分比(%) 45.3 59.540.93.3 血浆外泌体提取的蛋白 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳初步筛查差异蛋白图谱及蛋白定量数据首发精神分裂症患者、经药治疗精神分裂症患者和健康体检者血浆外泌体蛋白质 SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳图谱如图 3,蛋白电泳区带有显著差异。BCA 蛋白浓度测定试剂盒对上述血浆外泌体蛋白进行定量,定量结果如表 2 所示,每组外泌体蛋白质总量达 500ug 左右,符合质谱上机标准。
差异表达蛋白的分子功能富集分析
本文编号:2796376
【学位授予单位】:遵义医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R749.3
【图文】:
图 1. 经药物治疗的精神分裂症患者与健康体检者的 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱3.2 外泌体电镜结果及 NTA 粒径分析结果3.2.1 外泌体的透射电镜实验结果本研究利用透射电镜观察到粒径在 30~150nm 左右、茶托状或凹陷半球形的外泌体样结构。
表 1. 三组样品的粒径分布及其相应浓度数据样品 首发组经药物治疗组 健康体检组平均粒径(nm) 168.7 140.3159.7粒径主峰(nm) 106.9 122.1151.0总浓度(1×1010particle ml-1)4.39 5.54 4.96粒径 30nm -150nm 百分比(%) 45.3 59.540.93.3 血浆外泌体提取的蛋白 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳初步筛查差异蛋白图谱及蛋白定量数据首发精神分裂症患者、经药治疗精神分裂症患者和健康体检者血浆外泌体蛋白质 SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳图谱如图 3,蛋白电泳区带有显著差异。BCA 蛋白浓度测定试剂盒对上述血浆外泌体蛋白进行定量,定量结果如表 2 所示,每组外泌体蛋白质总量达 500ug 左右,符合质谱上机标准。
差异表达蛋白的分子功能富集分析
【参考文献】
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本文编号:2796376
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