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人类肠道菌群多样性与产前焦虑、产后抑郁的相关性研究

发布时间:2020-09-22 12:55
   目的:产前焦虑是孕妇在产前的出现的以焦虑情绪体验为主要特征,表现为对无明确客观对象的紧张担心,伴有心悸、手抖等植物神经功能失调症状及运动性不安等表现的一组与现实基础不符合并导致精神痛苦的疾病。产后抑郁是在产后的一段时间出现的以持久的心境低落,思维迟缓,意志活动减退,伴有自卑自责、无助无望,甚至悲观厌世,可有自杀企图或行为等表现的一类心境障碍。近年来,我们发现产前焦虑、产后抑郁的发病不仅与遗传、神经内分泌系统、免疫系统及社会环境等相关,还与自主神经系统、肠道微生物群等相关,但暂时还没有发现涉及人类的研究能明确的说明产前焦虑、产后抑郁与肠道微生物之间的关系,本研究旨在了解产前焦虑、产后抑郁的肠道微生物结构情况,及和产前焦虑、产后抑郁有明显相关性的微生物物种。方法:本研究通过随访在产前采集1次、产后采集3次的被试者粪便样品,并同时记录被试者的人口学资料,评定SAS、HAMA、HAMD、EPDS等量表。采集到的样品在提取DNA后进行PCR扩增,扩增后的DNA序列通过Illumina高通量测序方法测定其碱基序列,提取出有效序列后行OTU聚类,并与现有16s数据库行比对得到物种信息,然后进行多样性、物种丰度等后续分析,以了解产前焦虑、产后抑郁患者和健康对照组的肠道微生物结构,同时使用生物信息分析探索在门、纲、目、科、属等分类等级上产前焦虑、产后抑郁与健康对照组有显著性差异的物种。结果:研究结果表明,与健康孕妇相比,产前焦虑的患者Desulfovibrio(0.00138212,p0.05)、Clostridium sensu stricto(0.000491275,p0.05)、Clostridiaceae 1(0.000491275,p0.05)细菌比例增加。与同时期健康产妇相比,在产后4周时产后抑郁组患者Alphaproteobacteria(0.000170309,p0.05)、Oxalobacter(0.000314416,p0.05)细菌比例增加;产后8周时产后抑郁组患者Proteobacteria(0.0430095,p0.05)、Klebsiella(0.00120395,p0.05)、Coriobacteriaceae(0.00223366,p0.05)、Coriobacteriales(0.00223366,p0.05)、Rothia(0.000189960,p0.05)、Micrococcaceae(0.000189960,p0.05)、Actinomycetales(0.000235812,p0.05)、Alphaproteobacteria(0.000170309,p0.05)细菌比例增加;产后12周时产后抑郁组患者Coprobacter(0.00168999,p0.05)、Alphaproteobacteria(0.000786040,p0.05)、Holdemania(4.58523e-05,p0.05)、Erysipelotrichaceae(0.000379919,p0.05)、Erysipelotrichales(0.000379919,p0.05)、Clostridium XVIII(0.000301315,p0.05)、Erysipelotrichia(0.000379919,p0.05)、Clostridium XI(0.000170309,p0.05)、Peptostreptococcaceae(0.000170309,p0.05)细菌比例增加。在产后抑郁组患者在症状缓解后进行前后(产后4、8、12周)对比,在Oribacterium(5.24027e-05,p0.05)、Peptostreptococcaceae(0.00655688,p0.05)、Aggregatibacter(3.27517e-05,p0.05)细菌在抑郁情绪缓解的后两次随访中明显下降,而Actinomycetales(0.000235812,p0.05)、Candidatus Saccharibacteria(0.000235812,p0.05)、Cyanobacteria Chloroplast(0.000170309,p0.05)、Anaerostipes(0.00108080,p0.05)、Negativicutes(0.181490,p0.05)、Acidaminococcaceae(0.115070,p0.05)则在8周抑郁情绪缓解时增加,而在12周又下降。结论:产前焦虑与肠道中变形菌门的Desulfovibrio、厚壁菌门的Clostridium sensu stricto细菌比例增加相关;产后抑郁与变形菌门的Alphaproteobacteria和Oxalobacter细菌比例增加相关,缓解则与厚壁菌门的Oribacterium和Peptostreptococcaceae、变形菌门的Oxalobacter、Aggregatibacter细菌比例减少相关。总之,肠道内有害菌增加、有益菌减少可能会导致产前焦虑、产后抑郁的出现。
【学位单位】:西南医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:R749
【部分图文】:

示意图,引物设计,示意图,产物纯化


引物设计合成示意图

原理图,测序,原理图,聚类


西 南 医 科 大 学 硕 士 学 位 论 文21图 3 测序原理图3.2.6 生物信息分析对原始数据(PE reads)进行质控(QC)之后,用 Usearch 软件对数据行去嵌合体和聚类操作,其中 OTU (Operational Taxonomic Units)的聚类:在Usearch 平台上,将序列完全一样的 Clean Reads 根据其丰度大小进行排序,将其中的 Singletons 过滤掉 (Singletons 可能由于测序错误造成,故将这部分序列去除,不进行后期 OTU 聚类),在相似度 97%的标准聚类,对聚类后的序列进行嵌合体过滤后,得到用于物种分类的 OTU, 此时的每个 OTU 可认为能代表1 个物种。将所有 Clean Reads 比对到 OTU 序列上

分析流程,统计方法


图4分析流程图

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3 李姝s

本文编号:2824415


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