精神分裂症相关SNPs位点的病例—对照与家系合并样本的关联性研究

发布时间：2021-02-04 04:29

　　精神分裂症（schizophrenia）是一种严重危害人类心灵健康的常见精神疾病,多起病于青壮年,常有特殊的思维、知觉、情感和行为等多方面的障碍和精神活动与环境的不协调,精神活动丧失了统一性、完整性,严重损害患者的社会适应能力。一般无智能障碍,多数病程迁延。患者劳动能力显著丧失,给社会和家庭造成长期沉重的负担,并占用大量医疗卫生资源,其对社会经济负担居各种疾病前列。同时,由于患者的社会功能的丧失以及法律行为能力的丧失,也给社会的安定带来了不利因素。该病的病因及发病机制目前尚不清楚。通过家系、双生子以及寄养子研究都证明了遗传因素在精神分裂症的发病中起着重要的作用。至今,对精神分裂症的候选基因研究,已经获得了不少阳性结果,但重复性较差。而对于导致精神分裂症的主要的、特异性的易感基因的研究,还没有获得理想的结果。本研究以371个精神分裂症核心家系、950名患者、1095名与患者无血缘关系对照为研究对象,并将研究对象分为家系样本、普通病例对照样本以及家系与普通病例对照整合样本三组,在4个候选基因（PLA2G4A、TNXB、KPNB3、PEMT）上选择了4个SNPs遗传标记（rs10798059... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性方法图示

Pedigree Database 及 SPSS Database。.6.1.1 Pedigree Database利用 Excel 程序编辑 Pedigree Database。采用通用的遗传学分析文件格式，包括编Number，研究对象的流水编号），个体（ID，均为 1），父亲（F-ID，均为 0），母亲（M-I为 0），性别（Sex，男性为 1，女性为 2），状态（State，患者为 2，对照为 1）及遗记 SNPs 基因型。SNPs 基因型中 1 代表能被限制性内切酶切开的碱基，2 代表不能制性内切酶切开的碱基，即切开纯合型（1/1），杂合型（1/2）及未切开纯合型（2/edigree Database 主要用于多位点联合分析和数量性状分析。见图 2.2。.6.1.2 SPSS Database利用统计分析软件包（statistical packages for social sciences，SPSS 13.0）编辑 SPatabase。输入内容包括样本编号、年龄、性别、临床阳性和阴性症状、临床类型、病格、各 SNP 位点基因型及等位基因等信息。SPSS Database 主要用于数据资料的统述。见图 2.3。

.6.2 数据统计分析⑴ Hardy-Weinberg 平衡检验Hardy-Weinberg 平衡是指一种遗传性状或一个遗传标记发生频率在一个随机婚配中，世世代代保持平衡。假定 p 代表双态遗传标记的一个等位基因频率，q 代表另一位基因频率，那么在一个随机婚配群体中，基因型频率分布应符合二项式分布：即（ q）2= p2+ 2pq + q2= 1。应用 HaploView 4.1 软件分析病例组和对照组所研究的所有 SN点基因型频率的分布是否符合 Hardy-Weinberg 平衡，如果每个位点的 P 值 > 0.5，明样本符合 Hardy-Weinberg 平衡。⑵ 相关性分析应用 UNPHASED 3.012 软件分析 SNPs 分型资料，探讨其等位基因、基因型与精裂症的相关性，此外应用该软件进行基因-基因之间的相互作用以及数量性状分析。⑶ 等位基因相关性分析图 2.3 SPSS数据库格式示意图

【参考文献】：
期刊论文
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[2]精神分裂症心理社会因素分析流行病学研究[J]. 林勇强.  健康心理学杂志. 2002(02)
[3]人类基因组计划及中国的1%[J]. 赵凌霞.  化石. 2001(02)
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[5]蛋白质组学的进展[J]. 李林,sunm.shcnc.ac.cn.  生物化学与生物物理进展. 2000(03)
[6]精神分裂症分析流行病学的假说相关性研究[J]. 罗开林.  中国神经精神疾病杂志. 1993(02)
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本文编号：3017726