甲基化芯片检测APP/PS1双转基因小鼠基因组DNA甲基化分布
发布时间:2021-03-27 15:36
目的研究阿尔茨海默病(AD)动物模型APP/PS1双转基因小鼠基因组DNA甲基化分布。方法采用最新发展的甲基化DNA免疫共沉淀(Me DIP)结合高通量测序方法,检测APP/PS1双转基因小鼠皮层脑组织DNA甲基化分布。结果只在AD小鼠脑组织中存在的DNA甲基化片段有2 346个,涉及485个基因,这些DNA甲基化片段分布在不同的染色体上。部分甲基化基因具有一定家族聚集性。结论 APP/PS1双转基因小鼠与相应的野生型小鼠脑组织的DNA甲基化位点存在明显差异,提示DNA甲基化可能参与了AD的发生和发展。
【文章来源】:中国医科大学学报. 2015,44(02)北大核心CSCD
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 实验动物和分组:
1.1.2 组织标本取材:
1.1.3 甲基化芯片:
1.2 方法
1.2.1 Roche NimbleGen芯片系统质控:
1.2.2 Roche-NimbleGen MeDIP甲基化实验基本过程
1.2.2. 1 脑组织基因组DNA的提取和片段化
1.2.2. 2 免疫沉淀甲基化的DNA
1.2.3 DNA扩增标记:
1.2.4 杂交与清洗:
1.2.5 芯片扫描:
1.2.6 芯片图像的采集与数据分析:
2 结果
2.1 MseⅠ酶切后DNA片段检测
2.2 IP和Input样品WGA扩增产物检测
2.3 芯片杂交结果
2.4 甲基化芯片初步筛选结果
3 讨论
本文编号:3103755
【文章来源】:中国医科大学学报. 2015,44(02)北大核心CSCD
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 实验动物和分组:
1.1.2 组织标本取材:
1.1.3 甲基化芯片:
1.2 方法
1.2.1 Roche NimbleGen芯片系统质控:
1.2.2 Roche-NimbleGen MeDIP甲基化实验基本过程
1.2.2. 1 脑组织基因组DNA的提取和片段化
1.2.2. 2 免疫沉淀甲基化的DNA
1.2.3 DNA扩增标记:
1.2.4 杂交与清洗:
1.2.5 芯片扫描:
1.2.6 芯片图像的采集与数据分析:
2 结果
2.1 MseⅠ酶切后DNA片段检测
2.2 IP和Input样品WGA扩增产物检测
2.3 芯片杂交结果
2.4 甲基化芯片初步筛选结果
3 讨论
本文编号:3103755
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