女性重度抑郁障碍患者外周血环状RNA的生物信息分析

发布时间：2021-06-06 08:21

　　目的筛选女性重度抑郁障碍患者与健康女性之间呈现差异表达的环状RNA（circRNA）,探索可能与抑郁障碍相关的目标circRNA。方法采用高通量测序筛选3例女性重度抑郁障碍患者差异表达的circRNA,通过|log2FC|≥1, FDR< 0.05判定circRNA是否具有表达差异。选择差异程度最大的5个circRNA,根据circRNA的miRNA海绵功能,利用在线数据库预测circRNA可能靶向的miRNA,而后预测miRNA相关靶基因。通过GO生物学过程富集分析和KEGG信号通路富集分析,预测靶基因相关的生物学过程和信号通路。根据高通量测序结果,且具有与抑郁障碍相关的生物学过程及信号通路为依据,筛选与抑郁障碍相关的circRNA。结果通过差异程度最大的5个circRNA（hsa_circ₀020959、hsa_circ₀005959、hsa_circ₀033064、hsa_circ₀006862、hsa

【文章来源】：中华行为医学与脑科学杂志. 2020,29(08)北大核心CSCD

【文章页数】：5 页

【参考文献】：
期刊论文
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[7]抑郁症外周血circRNA的生物信息学分析[J]. 魏红辉,何明骏,牛威,朱晓丽,孔令明,姚高峰,陈升东,张理义.  中华行为医学与脑科学杂志. 2017 (05)
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博士论文
[1]CK2缺失介导抑郁症NRG1-ErbB4通路紊乱机制研究[D]. 曾宽.华中科技大学 2017

硕士论文
[1]应激致抑郁症小鼠海马CA1脑区的环状RNA表达谱分析[D]. 宋寒.河北医科大学 2018



本文编号：3213987