双相Ⅱ型障碍患者冲动攻击行为的全基因组DNA甲基化修饰研究

发布时间：2021-08-03 11:14

　　目的:探讨双相Ⅱ型障碍患者冲动攻击行为的全基因组DNA甲基化修饰。方法:对5例有冲动攻击行为的双相Ⅱ型障碍患者及5例无冲动攻击行为的双相Ⅱ型障碍患者的全血基因组DNA采用Illumina公司的人类450K甲基化芯片技术进行甲基化水平的分析。用R软件对原始数据进行预处理并筛选出样本分组间的差异甲基化位点。最后采用GCBI在线分析软件对差异候选基因进行功能富集分析。结果:（1）对攻击组与非攻击组样本进行甲基化位点筛选,QC Report检测得到各项指标符合Illumina的质量要求。（2）采用β值作为衡量甲基化程度的指标,攻击组与非攻击组所有样本的甲基化位点beta值密度曲线趋于一致,成呈“双峰曲线”分布。（3）采用Subset-quantile Within Array Normalisation（SWAN）算法进行芯片内的归一化处理,beta值密度曲线趋于一致、分组符合实验设计要求。（4）采用pooled t-test方法筛选组间的差异甲基化位点,攻击组与非攻击组样本比较甲基化水平有差别。（5）攻击组与非攻击组样本差异甲基化位点在染色体上的分布有差别。（6）按基因注释分类和CpG岛注释... 

【文章来源】：新疆医科大学新疆维吾尔自治区

【文章页数】：50 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

InfiniumⅠ探针设计图

图 2 Infinium Ⅱ 探针设计设计图Fig.2 II Type Infinium基化 450K 芯片大多数探针都是 Infinium Ⅱ 探表 2 甲基化 450k 的探针类型Table 2 Infinium_Design_Type

图 3 杂交质控图Fig.3 Hybridization Controls合成的模板而非扩增 DNA 产物来检测整个实验的效果 5 pM，1 pM 和 0.2 pM，产生三个不同的信号强度。可2(信号值)，纵轴是样本名称 。红色荧光表示未甲基化位

【参考文献】：
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本文编号：3319520