外周血miR-9-5p与精神分裂症的关联性研究
发布时间:2022-01-01 14:46
目的:探讨精神分裂症患者外周血中miR-9-5p、miR-328-3p和miR-144-3p的表达水平,并评估其对精神分裂症的诊断价值;预测差异表达microRNA所调控的靶基因,并探索其生物学功能和信号通路,为精神分裂症发病机制的研究提供新思路和理论依据。方法:选取15例精神分裂症患者和15例对照利用高通量测序技术初步筛查两组样本外周血中差异表达的microRNAs;采用Real-time quantitative PCR(RT-qPCR)法在精神分裂症患者和对照组对差异表达的microRNAs进一步验证,并评估其成为精神分裂症生物标志物的可行性;使用TargetScan7.2、DIANA-micro T和miRDB三个数据库预测miR-9-5p的靶基因,通过R软件对靶基因集合进行Gene ontology(GO)功能富集分析探究其参与的生物学过程、细胞组分和分子功能,Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析其可能参与的信号通路。结果:1.高通量测序结果显示miR-9-5p、miR-328-3p和miR-144-3p在精神分裂...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病例组与对照组差异表达miRNAs的火山图
第3章结果193.2.2差异表达microRNAs的聚类分析热图利用热图表示差异miRNAs表达量的聚类关系,通过热图可以看到miRNAs在精神分裂症患者与健康对照两组样本之间,存在明显的差异表达模式。见图3.2。图3.2病例组和对照组差异表达miRNAs的聚类热图注:每行表示一个miRNA,每列表示一个精神分裂症患者或健康对照的样本,以色阶显示miRNAs的相对表达量。3.2.3差异microRNAs的表达水平分析我们检测了所有差异miRNA的表达水平,根据筛选条件(详见2.3.3)确定hsa-miR-9-5p、hsa-miR-328-3p和hsa-miR-144-3p作为本研究的目的miRNAs。高通量测序结果显示这3个miRNAs在精神分裂症患者与健康对照者之间存在显著的差异表达,见表3.3。每个样本标准化后的表达量(TPM)如图3.3所示。
第3章结果20表3.3miR-9-5p、miR-328-3p和miR-144-3p的表达水平分析miRNACase(readcount)Control(readcount)log2FoldChangePmiR-9-5p13.22235.658-1.160<0.001miR-328-3p2528.2281429.9640.7480.002miR-144-3p830.124302.0671.0910.003图3.33个miRNAs在病例组和对照组中的表达量3.3差异表达microRNAs的RT-qPCR验证结果在RT-qPCR反应中,各个miRNA的扩增曲线均呈“S”型扩增,溶解曲线为单峰表示反应为特异性扩增,数据有效可信,miRNAs在qPCR反应中的部分扩增曲线和溶解曲线见图3.4和图3.5。图3.4miRNAs在PCR反应中的扩增曲线ABC
【参考文献】:
期刊论文
[1]表观遗传调控在胎源性精神疾病中的研究进展[J]. 鲍青悦,徐永君,盛慧,倪鑫. 中国医药导报. 2015(09)
[2]山东省≥18岁人群精神分裂症患病率、生命质量、应对方式及社会功能现状研究[J]. 张韶东,于德祥,王金明,赵学庆,岳可明,刘丰团,于源慧,姜翕球,江永华,赵长英,胡伯文,曹学义. 精神医学杂志. 2012(03)
[3]河北省精神分裂症的患病率、人口学特征及功能状况分析[J]. 崔利军,栗克清,崔泽,江琴普,高良会,张扬,李建峰,刘永桥,孙秀丽,韩延超,杨老虎,严保平,吕华,杨宝丽,杨怡静. 中国神经精神疾病杂志. 2007(03)
博士论文
[1]精神分裂症外周血miRNA-1908-5p表达分析及其靶基因与精神分裂症的关联研究[D]. 付颖利.吉林大学 2019
[2]精神分裂症外周血单核细胞中差异性表达lncRNA的临床和实验研究[D]. 陈升东.第二军医大学 2016
硕士论文
[1]精神分裂症患者血浆miRNA筛选验证及RABEP1基因多态性与体重变化的关联研究[D]. 张婷.皖南医学院 2017
[2]首发精神分裂症患者血浆microRNA-30e的表达水平及其与临床症状的关系[D]. 付广慧.大连医科大学 2017
[3]精神分裂症特异性生物标记物microRNA的临床初步验证[D]. 孙欣羊.第二军医大学 2014
本文编号:3562342
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病例组与对照组差异表达miRNAs的火山图
第3章结果193.2.2差异表达microRNAs的聚类分析热图利用热图表示差异miRNAs表达量的聚类关系,通过热图可以看到miRNAs在精神分裂症患者与健康对照两组样本之间,存在明显的差异表达模式。见图3.2。图3.2病例组和对照组差异表达miRNAs的聚类热图注:每行表示一个miRNA,每列表示一个精神分裂症患者或健康对照的样本,以色阶显示miRNAs的相对表达量。3.2.3差异microRNAs的表达水平分析我们检测了所有差异miRNA的表达水平,根据筛选条件(详见2.3.3)确定hsa-miR-9-5p、hsa-miR-328-3p和hsa-miR-144-3p作为本研究的目的miRNAs。高通量测序结果显示这3个miRNAs在精神分裂症患者与健康对照者之间存在显著的差异表达,见表3.3。每个样本标准化后的表达量(TPM)如图3.3所示。
第3章结果20表3.3miR-9-5p、miR-328-3p和miR-144-3p的表达水平分析miRNACase(readcount)Control(readcount)log2FoldChangePmiR-9-5p13.22235.658-1.160<0.001miR-328-3p2528.2281429.9640.7480.002miR-144-3p830.124302.0671.0910.003图3.33个miRNAs在病例组和对照组中的表达量3.3差异表达microRNAs的RT-qPCR验证结果在RT-qPCR反应中,各个miRNA的扩增曲线均呈“S”型扩增,溶解曲线为单峰表示反应为特异性扩增,数据有效可信,miRNAs在qPCR反应中的部分扩增曲线和溶解曲线见图3.4和图3.5。图3.4miRNAs在PCR反应中的扩增曲线ABC
【参考文献】:
期刊论文
[1]表观遗传调控在胎源性精神疾病中的研究进展[J]. 鲍青悦,徐永君,盛慧,倪鑫. 中国医药导报. 2015(09)
[2]山东省≥18岁人群精神分裂症患病率、生命质量、应对方式及社会功能现状研究[J]. 张韶东,于德祥,王金明,赵学庆,岳可明,刘丰团,于源慧,姜翕球,江永华,赵长英,胡伯文,曹学义. 精神医学杂志. 2012(03)
[3]河北省精神分裂症的患病率、人口学特征及功能状况分析[J]. 崔利军,栗克清,崔泽,江琴普,高良会,张扬,李建峰,刘永桥,孙秀丽,韩延超,杨老虎,严保平,吕华,杨宝丽,杨怡静. 中国神经精神疾病杂志. 2007(03)
博士论文
[1]精神分裂症外周血miRNA-1908-5p表达分析及其靶基因与精神分裂症的关联研究[D]. 付颖利.吉林大学 2019
[2]精神分裂症外周血单核细胞中差异性表达lncRNA的临床和实验研究[D]. 陈升东.第二军医大学 2016
硕士论文
[1]精神分裂症患者血浆miRNA筛选验证及RABEP1基因多态性与体重变化的关联研究[D]. 张婷.皖南医学院 2017
[2]首发精神分裂症患者血浆microRNA-30e的表达水平及其与临床症状的关系[D]. 付广慧.大连医科大学 2017
[3]精神分裂症特异性生物标记物microRNA的临床初步验证[D]. 孙欣羊.第二军医大学 2014
本文编号:3562342
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