基于全基因组关联数据识别抑郁症和失眠症的多效性易感位点

发布时间：2024-02-29 03:42

　　目的:利用条件性错误发现率(condFDR)和联合条件性错误发现率(conjFDR)分析方法,对抑郁症和失眠症的全基因组关联数据进行统计分析,识别并鉴定抑郁症和失眠症显著关联的多效性遗传变异位点,发掘两者之间共同的遗传学基础。方法:对来自公开数据库的全基因组关联数据进行分析,其中抑郁症全基因组关联数据来自精神疾病遗传学联盟(PGC),共包含246363例抑郁症患者和561190例正常对照,失眠症全基因组关联数据来自睡眠障碍知识门户,共包含1331010例受试者。分析流程包括:(1)通过构建不同阈值下的条件性分位图,全基因组范围内比较抑郁症和失眠症重叠单核苷酸多态性位点的关联程度,评估两种疾病之间遗传多效性位点的富集程度;(2)分别以抑郁症和失眠症为参考条件,利用条件性错误发现率分析方法,计算另外一种疾病的关联程度,以发现两种疾病的易感位点,并采用通路富集分析检验易感位点的生物学功能;(3)利用联合条件性错误发现率分析方法,鉴定与抑郁症和失眠症同时显著关联的多效性遗传位点,并对所发现的易感位点进行染色体位置和所在基因进行注释。同时,采用基因功能注释和通路分析方法,进一步探索所发现的易感位...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1技术路线图

济宁医学院硕士专业学位论文19眠症相关联的多效基因进行注释，我们使用(GeneOnotology，GO)进行通路分析，GO映射网络能将识别的特定基因在生物系统网络图中位置标记出来[29]。通过基因功能注释和通路分析从分子功能类别、所发生的细胞位置和生物过程这三个主要方面进行结果呈....

图2以失眠症为条件抑郁症的分层条件分位图

济宁医学院硕士专业学位论文41附录图2以失眠症为条件抑郁症的分层条件分位图图3以失眠症为条件抑郁症的分层富集图

图3以失眠症为条件抑郁症的分层富集图

济宁医学院硕士专业学位论文41附录图2以失眠症为条件抑郁症的分层条件分位图图3以失眠症为条件抑郁症的分层富集图

图4以抑郁症为条件失眠症的分层条件分位图

济宁医学院硕士专业学位论文42图4以抑郁症为条件失眠症的分层条件分位图图5以抑郁症为条件失眠症的分层富集图

本文编号：3914439