16SrRNA克隆文库法分析裕固族龋病和牙周病口腔微生物

发布时间：2017-03-28 02:02

  本文关键词：16SrRNA克隆文库法分析裕固族龋病和牙周病口腔微生物，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：研究背景； 龋病和牙周病是多种微生物引起的口腔内软硬组织的慢性破坏性疾病。口腔微生物被广泛认为在牙周病和龋病的发病机制中起到重要作用,但复杂的微生物群落结构和生态的确切作用仍有待完全建立。流行病学调查表明甘肃特有少数民族裕固族龋病和牙周病患病率高于其他少数民族。 目的； 使用16SrRNA基因克隆文库鉴别及分析裕固族牙周病和龋病微生物多样性。 方法； 裕固族龋病和牙周病患者含漱法采取唾液样本被用于建立16SrRNA基因克隆获取唾液中微生物总DNA,用16SrRNA通用引物扩增、回收、连接、转化、建立16SrRNA克隆文库及筛选,NCBI BLAST数据库序列对比找出已知相似性序列。用CExpress, Blast, Clustal, Treeview, seaview, Mega, Bioedit, mothur等软件进行系统发育树的构建。 结果； 克隆文库序列在NCBI BLAST数据库序列对比龋病20个克隆牙周病80个克隆序列。mothur软件对龋病克隆文库序列分析分为4个OTU。文库coverage值为90%,shanon-winner指数多样性指数1.56。通过mothur软件对牙周病克隆文库80个克隆子进行序列分析分为18个OTU,文库coverage值为76%,shanon-winner指数多样性指数2.42。 结论； 使用16SrRNA基因克隆文库分析裕固族牙周病和龋病微生物多样性。通过建立系统发育树亲缘关系拟分析出来龋病19种牙周病24种菌株及种属。本研究只做疾病样本微生物的分析没有对照健康和疾病之间的区别,需要用更多的样品探索龋病和牙周病微生物群落的多样性。
【关键词】：龋病 牙周病 口腔微生物 16srRNA基因克隆文库
【学位授予单位】：兰州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R781.1;R781.4
【目录】：

• 中文摘要3-5
• Abstract5-8
• 前言8-12
• 第一部分 利用16srRNA基因克隆文库分析裕固族龋病相关的微生物12-22
• 1.1 主要材料和试验器材12-14
• 1.2 临床检查14-15
• 1.3 样本采集及处理15
• 1.4 试验方法15-19
• 1.5 结果与小结19-22
• 第二部分 利用16srRNA基因克隆文库分析裕固族牙周病相关的微生物22-30
• 2.1 样本采集及处理22
• 2.2 试验方法22-26
• 2.3 结果和小结26-30
• 讨论30-32
• 结论32
• 展望32-33
• 参考文献33-36
• 在学期间的研究成果36-37
• 致谢37-38
• 综述38-48
• 参考文献44-48
• 病例汇报48-53

【共引文献】

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本文编号：271464