慢性、顽固性牙周炎的血液和唾液组织表达谱比较分析病例报告
发布时间:2024-03-04 18:33
目的:本文通过比较分析慢性牙周炎(CP)、顽固性牙周炎(RP)的血液和唾液组织中基因表达谱,筛选不同类型牙周炎在不同组织中具有特征代表性的基因,为区分和治疗不同类型牙周炎提供帮助。材料与方法:从GEO数据库中下载GSE43525数据,共23个患者血液和唾液组织表达谱样本:13个样本来自血液(包括4个正常人,4个CP,5个RP),10个样本来自唾液(包括3个正常人,4个CP,3个RP)。我们首先对每种类型的表达谱样本进行了样本描述比较,用limma软件包筛选两种牙周炎分别在血液和唾液中的差异表达基因,再对各组中筛选得到的差异表达基因进行层次聚类分析,然后分别用DAVID和KOBAS软件包进行功能富集及通路分析,最后借助WebGestalt方法,搜索得到显著相关的miRNA。结果:CP样本得到213个差异表达基因(DEGs),RP样本得到45个DEGs。功能富集分析显示CP患者血液和唾液的DEGs主要分别富集于与翻译相关生物学过程及细胞凋亡调控的通路上;而RP患者血液和唾液的DEGs主要分别富集在免疫应答的生物学过程及对有机物和细菌感染反应的通路上。搜索得到了一些与CP相关的miRNA如m...
【文章页数】:569 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本文编号:3919049
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