IRF6基因与新疆地区维吾尔人群非综合征性唇腭裂:基于二代测序技术的分析

发布时间：2017-09-09 22:38

  本文关键词：IRF6基因与新疆地区维吾尔人群非综合征性唇腭裂:基于二代测序技术的分析

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【摘要】：背景:目前缺乏关于新疆维吾尔族非综合征性唇腭裂相关易感基因研究相关遗传资料。目的:探讨IRF6基因与新疆地区维吾尔人群非综合征性唇腭裂的相关性。方法:选择久居新疆的维吾尔族非综合征性唇腭裂患者100例和同期上呼吸道感染儿童60例做对照组,用第二代测序技术对IRF6基因编码区、5’UTR区及第一外显子前500 bp进行测序。结果与结论:将测序结果与基因组数据库进行比较,共发现11个高频SNPs位点:rs861019、rs7552506、rs2235377、rs2235371、rs2013162、rs7545538、rs7545542、rs12403006、rs846808、rs34743335、rs2235373。rs7545538(CG,P=0.007),rs7545542(CT,P=0.044)和rs2235373(GA,P=0.049)等位基因分布在病例组与对照组间差异有显著性意义(P0.05);rs7545538基因型分布在病例组与对照组间差异有显著性意义(P=0.037);余位点等位基因与基因型分布在病例组与对照组间差异无显著性意义(P0.05)。对以上11个高频SNPs进行单倍型分析,共构成2个单倍体域,第一个单倍体域最常见的单倍型有4种:CCGGTCCGATCACATTAGAC,其中最有意义的单倍型为CCGAT(P=0.032);第二个单倍体域最常见的单倍型有3种:TACATGTAG,其中最有意义的单倍型为TAC(P=0.009),TAG(P=0.003)。分析结果发现,IRF6基因与非综合征性唇腭裂的发生可能存在相关性。
【作者单位】： 新疆医科大学第一附属医院颌面外科;喀什地区第一人民医院颌面外科;
【关键词】： 腭裂 干扰素调节因子类 多态性 单核苷酸腭裂 干扰素调节因子类 多态性 单核苷酸 组织构建 组织工程 非综合征性唇腭裂 干扰素调节因子 单核苷酸多态性 二代测序 维吾尔族 国家自然科学基金
【基金】：国家自然科学基金(81260163)~~
【分类号】：R782.2
【正文快照】： 0引言IntroductionNSCL/P患者发病中可能起的作用,揭示种族遗传背景因素非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(non-syndromic cleft在唇腭裂发生中所起的独特作用,也为中国维吾尔族人群lip with or without cleft palates,NSCL/P)是指不伴有其他基因信息库累积更多的资料,填补此项空白,

【参考文献】

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本文编号：823171