应用MLST系统进行中国幽门螺杆菌的分子流行病学研究

  本文关键词：应用MLST系统进行中国幽门螺杆菌的分子流行病学研究，由笔耕文化传播整理发布。

应用MLST系统进行中国幽门螺杆菌的分子流行病学研究

第三军医大学硕士学位论文

息进行ＭＬＳＴ分析，得到菌株的等位基因图谱。确定Ｈｐｙ肠一临床分离株的序列分型（ＳｅｑｕｅｎｃｅＴｙｐｅ，ＳＴ），并与国际菌株进行比较。应用ＢＵＲＳＴ（Ｂａｓｅｄ

ＳｅｑｕｅｎｃｅＵｐｏｎＲｅｌａｔｅｄＴｙｐｅｓ）运算规则将菌株归为各个谱系组（ｃｌｏｎａｌｃｏｍｐｌｅｘ），应用ＳＴＡＲＴ程序计

ｏｆ算相关系数（ｉｎｄｅｘａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ，厶）并进行系统进化树的构建。

４．针对ｖ以ｃＡ基因信号区及中间区序列设计引物，检测Ｈｐｙ如ｒｆ的等位基因，１，日ｃＡｓｌａ、ｖ口ｃＡｓｌｂ、ｖ以ｃＡｓ２、ｖ以ｃＡｍ１、ｖ以ｃＡｍ２。确定菌株所属的ｖ以ｃＡ基因亚型。

结果：

１．ＰｃＲ扩增所筛选的Ｈｐ），励一的８个管家基因的核心核酸片段，对４０株日．ｐｙ励以临床分离株进行ＭＬＳＴ分析，８个基因座位多态性位点从ａｔｐＡ的１．７７％到ｍｕｔＹ的３．８６％不等。一共获得了３８个ＳＴｓ序列型，均为在幽门螺杆菌ＭＬＳＴ数据库中未报道的。

２．菌株核酸序列的ＳＴ型结果按类平均数聚类方法（ＵＰＧＭＡ）绘制进化树，得到的样本菌株树形聚类图，，显示了菌株的亲缘关系，可将４０株ＨｐｙｆＤ订菌株大致分为三大类。

３．ｖ口ｃＡ基因分型结果，ｖ口ｃＡｓｌａ阳性为３３株（８２．５％），ｖ以丛ｓｌｂ阳性为７株（１７．５％），ｖ口ｃＡｍ２阳性为３９株（９７．５％），未发现Ｊ２型菌株，其中标准株ＮＣＴＣｌｌ６３７和１１６３８的结果为ｖ口ｃＡｓ１“ｍ１型。

结论：

１．首次应用ＭＬｓＴ的方法对中国４个大城市的ＨｐｙＺＤ一临床分离株进行了研究，本实验中等位基因的多样性与Ｈｐｙ胁一ＭＬＳＴ数据库中之前的研究结果差异不大。所得到的ＳＴｓ序列型，不属于原有的谱系。同时Ｓｉｎ９１ｅｔｏｎ序列型在本实验中占了大部分（９５％），与其它基因型相比它们代表了遗传距离较远的基因型。

２．对幽门螺杆菌菌株进行了ｖ口ｃＡ基因分型，结果以ｓ１“ｍ２型为主，消化性溃疡组与慢性胃炎组之间ｓｌａ型有显著性差异，而ｍ２型差异无显著性。提示可能从消化性溃疡患者胃粘膜标本中分离出ｖ以ｃＡｊＪｆ口型的可能性高于其他慢性胃炎的患者，而１，口ｃＡｍ２型则与Ｈｐｙ胁一相关胃部疾病的相关性不大。

３．由于样本量的限制，ｖ日甜基因分型结果与ＭＬＳＴ序列型之间未发现明确关联，但是可以相信随着ＨｐｙｆＤ—ＭＬＳＴ数据的增加，可以更加明确基因型间的遗传相关性。ｍ１、

关键词：幽门螺杆菌；多位点序列分析；ｖ以ｃＡ基因；管家基因；序列型

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