重庆地区儿童A族链球菌分子流行病学调查研究

发布时间：2018-03-04 04:06

  本文选题：A族链球菌　切入点：红霉素　出处：《重庆医科大学》2009年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】： 目的:(1)分析重庆地区儿童GAS感染株与携带株大环内酯类抗生素耐药基因(ermB、ermTR、mefA)的分布特点。(2)分析重庆地区儿童GAS感染株8种超抗原基因(ssa、smeZ、speA、speC、speG、speH、speI、speJ)的分布特点。(3)分析2007年收集的扁桃体炎患儿GAS分离株emm基因、大环内酯类抗生素耐药基因和超抗原基因相关性。 方法:PCR方法检测大环内酯类抗生素耐药基因(ermB、ermTR和mefA)、超抗原基因(ssa、smeZ、speA、speC、speG、speH、speI和speJ)及emm基因。emm基因产物测序,结果在CDC网站(http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/doc.htm)进行比对分型。 结果(:1)217株GAS中,耐药基因ermB基因检出212株(97.1%),ermTR基因检出136株(62.7%),mefA基因检出12株(5.5%),ermTR基因在健康儿童携带株(71.8%)明显高于儿童GAS感染分离株(50.5%)(P=0.0010.05),差异有统计学意义;GAS感染分离株ermTR基因由2007年66.0%减少到2008年30.0%,明显减少(P=0.0010.05),差异具有统计学意义)。(2)儿童GAS感染株93株,超抗原基因ssa和speH检出93株(100.0%),smeZ检出90株(96.8%),speC检出83株(89.2%),speG检出74株(79.6%),speI检出55株(59.1%),speA检出37株(39.8%),speJ检出15株(16.1%);2007年和2008年超抗原基因比较,2007年speA基因检出率50.9%,2008年检出率25.0%,两年内出现了明显地下降(P=0.0110.05),差异具有统计学意义。在93株儿童GAS感染分离株中,共有18个不同的超抗原分类,其中最常见的超抗原分类是Profile A,有31株(33.3%)。(3)2007年儿童扁桃体炎GAS分离株emm分型以emm12最多见,共26株(占59.1%);其次为emm1,共7株(占15.9%);少见的emm型为emm22有2株,emm6有2株,emm3有2株,emm80、emm63、emm102、stg485和st1815分别各有1株。7株emm1菌株有6株检出speA基因(占85.7%),26株emm12菌株有7株检出speA基因(占26.9%),speA基因检出率在emm1菌株中明显高于emm12菌株,差异具有统计学意义(P=0.008,0.05);ProfileA是emm12型最常见的超抗原分类,有11株,占了emm12型的42.3%。耐药基因ermB、ermTR和mefA在不同的emm型中分布是随机的,emm分型和耐药基因之间未发现明显相关性。 结论:(1)重庆地区儿童GAS对大环内酯类的耐药机制以ermB基因编码的23SrRNA甲基化酶致靶位改变为主,耐药表型主要以cMLSB为主的结构性耐药,即对大环内酯类、林可酰胺类抗生素和链阳性菌素B交叉耐药;GAS耐药模式由可诱导性耐药转变成结构性耐药,导致ermTR基因在健康儿童携带株明显高于感染株,同时也导致感染株ermTR基因在两年内有减少的趋势。(2)speC基因与非侵袭性GAS感染尤其是咽部感染有关;speA基因分布在两年内有明显下降的趋势,推测GAS严重感染有下调的趋势;Profile A是重庆地区儿童非侵袭性感染尤其是扁桃体炎最常见的超抗原分类。(3)2007年重庆地区儿童扁桃体炎GAS菌株emm分型以emm12和emm1为主;emm型与大环内酯类抗生素耐药基因分布无明显相关性,speA的分布主要与emm1有关,Profile A是emm12型最常见的超抗原基因分类。
[Abstract]:Objective to analyze the distribution characteristics of eight superantigen genes of GAS infection strains and macrolide antibiotic resistant strains of GAS in children in Chongqing area.) to analyze the distribution characteristics of 8 superantigen genes of GAS infection strains in Chongqing area. Emm gene of GAS isolated from children with tonsillitis, Relationship between macrolide resistance gene and superantigen gene. Methods the macrolide resistant genes (mBERmTR and mefAr), the superantigen gene (SSA) and the emm gene (spespespespespespehspehspeI and speJM) and the products of the emm gene (.emm) were sequenced. The results were compared with each other on the CDC website http: / / www.cdc.gov.ncidtechstrep.doc.htm. Results in 217 strains of GAS, The detection of ermB gene in 212 strains of drug resistance gene was significantly higher than that in healthy child carrier strain (71.8%), which was significantly higher than that in children with GAS infection strain 50.5% (P 0.0010.05). The difference was statistically significant between the two strains. The difference was statistically significant between 2007 and 2007, the ermTR gene of the gas infection isolate was significantly higher than that of the healthy child carrier strain (71.8%). There was a significant difference in the ermTR gene of the ermTR gene of the gas infection isolate. The results showed that in 2007, the ermTR gene of the GAS-infected strain was significantly higher than that of the healthy child carrier strain (71.8%). 66.0% was reduced to 30.010. 05% (P < 0. 0010. 05). The difference was statistically significant (P < 0. 05). 93 strains of superantigen gene ssa and 93 strains of speH were detected by ssa and speH. 90 strains were detected in 96.8i and 83 strains were detected in 89.2% speC. 74 strains were detected by Seventy-four strains, and 55 strains were detected out of 59.8speJ by speH. The detection rate of speA gene was 50.9%, 25.0%, 25.0% and 25.0% respectively in 2007, and the detection rate of speA gene in 2007 was 25.0%, and the detection rate was 25.0% in 2007 and 25.0% in two years compared with that of 2007 and 2008, and the detection rate of speA gene was 50.9%, 25.0% and 25.0% respectively in 2007, and the detection rate was 25.0 in 2007 and 25.0 in two years. The difference was statistically significant among 93 isolates of GAS infection in children. There were 18 different superantigen taxonomy, of which the most common superantigen classification was Profile A, there were 31 strains of GAS isolated from children with tonsillitis. In 2007, emm12 was the most common type of emm in children with tonsillitis. A total of 26 strains (59.1%), followed by emm1 (7 strains) (15.9%); the rare emm type was emm22 (2 strains), and there were 2 strains of emm 3, 2 strains of emm m ~ 3, 1 strain of emm1 (7 strains of emm1), 6 strains of emm12 strains (accounting for 85.7m%), 6 strains of speA gene were detected. The detection rate of speA gene in emm1 strains was significantly higher than that in emm12 strains. The difference was statistically significant (P < 0.01). ProfileA was the most common superantigen classification of emm12 type, with 11 strains, accounting for 42.3% of emm12 type. There was no obvious correlation between the distribution of ermBmTR and mefA in different emm types. Conclusion the drug resistance of GAS to macrolides in children in Chongqing area is mainly caused by the alteration of 23s rRNA methylase target encoded by ermB gene, and the resistance phenotype is mainly structural resistance of cMLSB, that is, macrolides. The pattern of resistance of linamide antibiotics and streptavidin B cross resistant drugs was changed from inducible resistance to structural resistance, which resulted in the ermTR gene being significantly higher in healthy children than in infected strains. At the same time, the ermTR gene of the infected strain showed a decreasing trend in two years. The distribution of the speC gene related to non-invasive GAS infection, especially the pharyngeal infection, decreased significantly within two years. It is speculated that GAS severe infection is down-regulated. Profile A is the most common superantigen classification of non-invasive infection in children in Chongqing, especially tonsillitis.) in 2007, emm typing of GAS strains in children with tonsillitis in Chongqing area was mainly emm12 and emm1. There was no significant correlation with the distribution of macrolide antibiotic resistance genes. The distribution of spea was mainly related to emm1, which was the most common superantigen gene classification of emm12 type.
【学位授予单位】：重庆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2009
【分类号】：R725.1;R181.3

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本文编号：1564038