中国南方地区马尔尼菲青霉分子流行病学初步研究
本文选题:马尔尼菲青霉菌 切入点:多位点微卫星基因分型 出处:《中国人兽共患病学报》2014年01期 论文类型:期刊论文
【摘要】:目的分离及鉴定贵州、广西、广东各地临床分离的马尔尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM),通过微卫星基因多态性分析进行分子流行病学初步研究。方法从贵州、广西、广东地区临床病人标本中分离马尔尼菲青霉,通过形态学及ITS序列进行鉴定,运用多位点微卫星分型法(multilocus microsatellite typing,MLMT)和SPSS18.0软件对分离的马尔尼菲青霉进行基因多态性及其相关性分析。结果贵州、广西和广东共收集鉴定马尔尼菲青霉临床株50株,3个微卫星位点PMMI、PMMII、PMMIII分别检测到29、9和8种等位基因,50株菌共分为47个微卫星型(PMMT);聚类分析将贵州及广西、广东地区马尔尼菲青霉分为6大类(Cluster1-Cluster 6)。结论贵州、广西、广东地区的马尔尼菲青霉具有较高的基因多态性,我国南方地区相邻省份马尔尼菲青霉的种群基因结构与地域分布之间存在着一定的相关性。
[Abstract]:Objective to isolate and identify Penicillium marneffeii PMN (Penicillium marneffeii) from Guizhou, Guangxi and Guangdong, and to study the molecular epidemiology of Penicillium marneffeii PMN by microsatellite gene polymorphism analysis. Penicillium marneffei was isolated from clinical patients in Guangdong area and identified by morphology and ITS sequence. Multilocus microsatellite typing (MLMTT) and SPSS18.0 software were used to analyze the genetic polymorphism of Penicillium marneffei and its correlation with multilocus microsatellite typing. Fifty clinical strains of Penicillium marneffei were collected and identified in Guangxi and Guangdong, and 29 9 and 8 alleles of PMMII / PMMIII were detected in 3 microsatellite loci, respectively. Penicillium marneffei can be divided into 6 groups of cluster 1-cluster 6. Conclusion Penicillium marneffei in Guizhou, Guangxi and Guangdong has high gene polymorphism. There is a certain correlation between the genetic structure of Penicillium marneffei population and its geographical distribution in southern China.
【作者单位】: 贵阳医学院微生物学教研室暨蛋白组学重点实验室;广西壮族自治区龙潭医院检验科;贵阳医学院附属医院皮肤性病专科;
【基金】:国家自然基金地方项目(31060006及3126002号) 贵州省卫生厅科学技术基金项目(gzwkj2011-1-060) 贵州省社会发展科技攻关项目(黔科合SY字[2011]3017号) 贵阳市科技局社会发展与民生计划(筑科合同[2011103]16号)~~
【分类号】:R379
【参考文献】
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,本文编号:1645498
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