2011年甘肃省和陕西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析

发布时间：2016-11-17 11:58

  本文关键词：2009-2011年甘肃省和陕西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析，由笔耕文化传播整理发布。

《兰州大学》 2013年

2009-2011年甘肃省和陕西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析

张鹏  

【摘要】：目的：研究我国甘肃省、陕西省流行的人副流感病毒(Human Parainfluenza viruse, HPIVs)的基因特征和流行规律,为中国大陆人副流感病毒分子流行病学研究累积数据。 方法：2009年1月至2011年12月共采集甘肃省和陕西省因急性呼吸道感染的住院患者的咽拭子标本719份,采用多重反转录聚合酶链反应(Multiplex reverse transcription polymerase chain reaction,多重RT-PCR)方法对常见呼吸道病毒性病原体进行筛查。多重RT-PCR筛查HPIVs阳性的标本用巢式PCR (nested polymerase chain reaction， nested PCR)扩增其血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase, HN)基因,扩增产物采用全自动核酸分析仪进行分析,HN阳性样本进行序列测定和基因分析。根据序列测定结果进行核苷酸和氨基酸(Amino acid, AA)同源性分析,应用比邻法(Neighbor-Joining Tree)建立HPIVHN基因系统进化树。 结果：经多重PCR筛选出67份感染HPIVs的样本,其中39份为HPIVs与其它呼吸道病毒混合感染的样本。巢式PCR和序列测定分析共得到HPIVs HN蛋白基因全长序列17条,其中HPIV-12条、HPIV-22条和HPIV-313条。2株HPIV-1均属于B群,其核甘酸和氨基酸的同源性分别为99.2%和100%；与17株日本代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.3%-98.8%和96.5-99.7%,其中分别与AB641251/Yamagata/07/2072、AB641301/Yamagata/2145/09的核苷酸同源性最大,分别为98.8%、98.8%、98.7%,和98.7%,但是氨基酸同源性皆为100%。2株HPIV-2(?)中gansu11-62110396属A群、gansu11-s191属于B群,2株HPIV-2的HN全基因序列的核苷睃和氨基酸同源性分别为92.5%和94.3%；与18株HPIV-2代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.7%-98.4%和94.2%-98.4%。Gansul1-62110396与Oklahoma/94/USA/09的核苷酸和氦基酸同源性最大,分别为97.6%和98.4%,而gansu11-s191则与日本分离株4-80/04的核苷酸同源性最大,为98.4%,但氨基酸同源性仪为97.7%。13株HPIV-3均属C3亚群,其核苷酸和氦基酸同源性分别为97.8%-99.8%和98.9%-100%；与美国、加拿大和澳大利亚的HPIV-3的HN基因序列之间的核苷酸和氨基酸同源性较小,最小分别为94.0%和96.6%。Shaanxi09-2与shaanxi10-H0091、shaanxi10-H0091与gansu11-62110372以及shaanxi09-2与BJ/291/09之间的核苷酸同源性分别为99.4%、99.3%和99.4%,但是其氨基酸同源性均为100%。 结论：2009-2011年甘肃省和陕西省的HPIVs流行毒株以HPIV-3株为主,均属C3亚群,提示甘肃和陕西两省不同年份间存在HPIV-3的持续循环传播；并且和日本的HPIVs毒株的核苷酸和氨基酸同源性比较高,提示HPIVs的流行毒株存在一定的地域局限性。HPIV-1株和HPIV-2株仅在甘肃省散在发病。

【关键词】：
【学位授予单位】：兰州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R181.3;R373.13
【目录】：

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