滇南主要口岸入境人群HIV-1分子流行病学研究

发布时间：2017-04-15 15:30

  本文关键词：滇南主要口岸入境人群HIV-1分子流行病学研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：人类免疫缺陷病毒感染导致的艾滋病是威胁全球人类健康的公共卫生问题。根据联合国艾滋病规划署发布的《2013年艾滋病疫情报告》,截至2012年底,全球存活的艾滋病病毒感染者和病人3530万(3220万～3880万),新发HIV感染者230万人(190万～270万),艾滋病相关死亡人数160万人(140万～190万)。而南亚和东南亚地区的新发感染人数为27万(16万～44万),死亡人数为22万(15万～31万)。东南亚地区是亚洲HIV-1感染较为严重的地区之一,而云南省是连通中国和东南亚国家的窗口,也是中国HIV-1基因亚型起源,流行和传播的中心。研究云南省HIV-1的分子流行病学特征,了解它的进化规律或传播规律,对制定防控措施和疫苗生产以及治疗药物的开发等都有重要的指导意义。云南省位于中国的西南边境,与缅甸、老挝和越南3国接壤,由于毗邻全球最大的毒品生产地——“金三角”地区,成为毒品进入中国及其邻国市场的主要通道。随着我国面向东南亚对外开放和边境贸易的发展,云南经各边境口岸的跨境人员也不断增加,随之也带来各种传播性疾病的跨境传播。已有研究对中缅跨境人群HIV-1感染与基因型分布进行了报道,但较少有关于云南省南部口岸跨境人群HIV-1感染情况的研究报告。云南省南部有红河州河口口岸,普洱市勐康口岸,西双版纳州打洛口岸,以及西双版纳国际机场等口岸与东南亚国家直接相通,成为人员跨境和贸易往来繁忙区域。本文选择红河和西双版纳两地州的入境人群进行HIV-1分子流行病学研究,以阐明滇南主要口岸入境人群HIV-1的流行与传播规律。研究对从2003年到2012年募集的326例滇南主要口岸入境HIV-1感染者,采集、提取并储存血浆中病毒RNA,用RT-Nested-PCR方法进行gag-RT区(2.6kb)基因扩增,分为gag (1155bp)、gag-prot (885bp)和RT (1010bp)3个区段,经序列测定拼接后,成功获得163例样本的gag-RT区(2.6kb)序列。采用MEGA6.0软件进行病毒的同源关系分析以确定其基因型,发现HIV-1人群中存在种类多样的HIV-1基因亚型和重组型,包括82例CRF01_AE (50.3%)、38例CRF08_BC (23.3%)、10例CRF07_BC(6.1%)、2例SGR_0708 (1.2%)、3例C(1.8%)、2例B(1.2%)和26例URFs(16%)。可见,CRF01_AE为主要流行基因型,其次流行的是CRF08_BC、 CRF07_BC,而“单亚型”B和C退之其后。在已知传播途径的感染者中,以性接触为主要传播途径(90.1%),可能导致CRF01_AE的主要流行。另外,在该人群中存在多种模式的独特重组(URFs),包括10例B/C、5例CRF08_BC/CRF07_BC、4例CRF01_AE/C、3例CRF01_AE/B、2例CRF01_AE/CRF08_BC、1例C/A1和1例CRF58_01B/B/C=Simplot分析发现7种URFs除C/A1、CRF58_01B/B/C重组模式只有一种重组结构外,其他的重组模式都有2种或2种以上的重组结构。其中B/C有4种重组结构,CRF08_BC/CRF07_BC有2种重组结构,CRF01_AE/C有4种重组结构,CRF01_AE/B有3种重组结构,CRF01_AE/CRF08_BC有2种重组结构。在这些URFs中,CRF01_AE/C、C/A1、 CRFO1_AE/CRF08_BC和CRF58_01B/B/C 4种重组亚型在云南其他地方或中国其他地区还没有过报道,这说明滇南主要口岸入境人群中HIV-1基因亚型分布复杂。综上所述,滇南主要口岸入境人群中存在一定程度的HIV-1流行,且基因亚型种类较多,并存在大量的URFs重组型,入境人群成为HIV-1跨境传播的主要携带者。对滇南主要口岸入境人群的HIV-1分子流行病学特点的阐明,有助于了解云南省HIV-1的传播规律并预测将来的流行态势,对制定HIV-1预防措施,以及疫苗的研制具有重要意义。
【关键词】：艾滋病 HIV-1 分子流行病学 基因亚型 独特重组 重组模式
【学位授予单位】：昆明理工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R512.91;R181.3
【目录】：

• 摘要6-8
• ABSTRACT8-16
• 英文缩写词表16-18
• 第一章 绪论18-37
• 1.1 艾滋病病毒与艾滋病18-19
• 1.2 AIDS的流行与危害19-23
• 1.2.1 全球AIDS流行现状19-20
• 1.2.2 亚洲AIDS流行现状20-22
• 1.2.3 云南省HIV流行现状22-23
• 1.3 HIV病原学特点23-28
• 1.3.1 HIV的基因组结构及其编码蛋白23-26
• 1.3.2 HIV的复制26-27
• 1.3.3 HIV的传播途径27-28
• 1.4 HIV的诊断与治疗28-31
• 1.4.1 免疫学方法28-29
• 1.4.2 分子生物学检测方法29-30
• 1.4.3 基因芯片技术的应用30
• 1.4.4 艾滋病的发病机制和目前的治疗状况30-31
• 1.5 HIV基因亚型检测方法31-34
• 1.5.1 HIV基因分型技术31-33
• 1.5.2 HIV重组型鉴定33-34
• 1.6 本论文研究的目的意义和技术路线34-37
• 1.6.1 本论文研究的目的意义34-36
• 1.6.2 本论文研究的技术路线36-37
• 第二章 云南省跨境流动人口与艾滋病传播37-46
• 2.1 引言37-38
• 2.2 云南省出入境内口岸分布38-39
• 2.3 云南省跨境流动人口HIV-1感染者的人口学特征39-41
• 2.4 滇南主要口岸入境人群HIV-1感染者的人口学特称41-44
• 2.5 讨论44-45
• 2.6 本章小结45-46
• 第三章 云南省红河州入境人群HIV-1基因亚型分布研究46-64
• 3.1 引言46
• 3.2 实验材料与方法46-54
• 3.2.1 研究对象46-47
• 3.2.2 实验仪器设备与试剂47-48
• 3.2.3 数据分析工具48-49
• 3.2.4 实验方法49-53
• 3.2.5 数据分析53-54
• 3.3 实验结果54-60
• 3.3.1 红河州入境人群HIV-1人口学特征54-55
• 3.3.2 红河州入境人群HIV-1基因型分布特点55-58
• 3.3.3 红河州入境人群HIV-1重组型分析58-60
• 3.3.4 03～12年红河州入境人群CRF01_AE基因亚型的起源与进化分析60
• 3.4 讨论60-63
• 3.5 本章小结63-64
• 第四章 云南省西双版纳州入境人群HIV-1基因亚型分布研究64-72
• 4.1 引言64
• 4.2 实验材料和方法64-65
• 4.2.1 研究对象64
• 4.2.2 实验仪器设备与试剂64-65
• 4.2.3 数据分析工具65
• 4.2.4 实验方法65
• 4.3 实验结果65-70
• 4.3.1 西双版纳州入境人群HIV-1感染者人口学特征65-66
• 4.3.2 西双版纳州入境人群HIV-1基因型分布特点66-69
• 4.3.3 西双版纳州入境人群HIV-1重组型分析69-70
• 4.4 讨论70-71
• 4.5 本章小结71-72
• 第五章 滇南主要口岸入境人群HIV-1 URFS重组模式分析72-86
• 5.1 引言72
• 5.2 实验材料和方法72-73
• 5.2.1 研究对象72
• 5.2.2 实验仪器设备与试剂72-73
• 5.2.3 数据分析工具73
• 5.2.4 实验方法73
• 5.3 实验结果73-79
• 5.3.1 26例HIV-1gag-RT基因进化树分析结果73-74
• 5.3.2 Simplot对26例URFs的重组断点分析结果74-79
• 5.4 HIV-1代表株近全长基因组分析79-82
• 5.4.1 HIV-1代表株各区段进化树分析79-81
• 5.4.2 HIV-1代表株Simplot分析81-82
• 5.5 讨论82-85
• 5.6 本章小结85-86
• 第六章 结论86-88
• 6.1 云南省跨境流动人口与艾滋病传播86
• 6.2 云南省红河州入境人群HIV-1的流行概况86-87
• 6.3 云南省西双版纳州入境人群HIV-1的流行概况87
• 6.4 滇南主要口岸入境人群HIV-1 URFs流行概况87-88
• 致谢88-89
• 参考文献89-100
• 附录A 攻读硕士期间发表论文目录100

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

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本文编号：308714