2017-2019年广州市禽类市场H9N2禽流感病毒全基因组遗传进化特征分析
发布时间:2021-05-21 16:26
目的对H9N2禽流感病毒分离株进行全基因进化特征分析,为禽流感的防控提供研究数据。方法对24株2017—2019年广州市禽类市场H9N2禽流感毒株进行测序,通过生物信息学软件,分析全基因组遗传进化特点。结果 24株H9N2病毒核苷酸同源性为86.20%~100.00%,核苷酸进化距离为0.00~1.54,其中HA基因的核苷酸和氨基酸进化距离变化最大,其次为PB2基因。遗传进化分析显示,所有毒株各基因在系统发生树上聚为一簇,属于G57基因型。分子特征分析显示,所有毒株属于低致病性禽流感病毒,在HA蛋白受体结合位点均发生Q226L突变,提示H9N2更容易识别人源受体。在HA-N166D、PB2-L89V/292V、PB1-I368V、L473V、PA-K356R、S409N、M1-N30D、T215A、NS1-P42S等致病性相关位点上,大部分毒株发生致病性增强突变。耐药性上,所有毒株对神经氨酸酶抑制剂敏感,对烷胺类药物耐药。结论 2017—2019年期间广州市禽类市场H9N2禽流感病毒为G57基因型,该基因型病毒普遍发生与人受体结合能力增强的稳定变异,且大部分毒株发生致病性增强的突变,需...
【文章来源】:疾病监测. 2020,35(03)
【文章页数】:6 页
【参考文献】:
期刊论文
[1]The D253N Mutation in the Polymerase Basic 2 Gene in Avian Influenza(H9N2) Virus Contributes to the Pathogenesis of the Virus in Mammalian Hosts[J]. Jinfeng Zhang,Rong Su,Xiaoyun Jian,Hongliang An,Ronbing Jiang,Chris Ka Pun Mok. Virologica Sinica. 2018(06)
[2]广州市活禽市场7株H9N2亚型禽流感病毒全基因进化分析[J]. 蔡孟楷,张伟东,秦锋,卜德新,黄俊明,冀池海,方博,付新亮,曹振鹏,张桂红. 中国预防兽医学报. 2018(02)
本文编号:3200021
【文章来源】:疾病监测. 2020,35(03)
【文章页数】:6 页
【参考文献】:
期刊论文
[1]The D253N Mutation in the Polymerase Basic 2 Gene in Avian Influenza(H9N2) Virus Contributes to the Pathogenesis of the Virus in Mammalian Hosts[J]. Jinfeng Zhang,Rong Su,Xiaoyun Jian,Hongliang An,Ronbing Jiang,Chris Ka Pun Mok. Virologica Sinica. 2018(06)
[2]广州市活禽市场7株H9N2亚型禽流感病毒全基因进化分析[J]. 蔡孟楷,张伟东,秦锋,卜德新,黄俊明,冀池海,方博,付新亮,曹振鹏,张桂红. 中国预防兽医学报. 2018(02)
本文编号:3200021
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/liuxingb/3200021.html