维生素D及其代谢通路遗传多态与结核病发病风险和预后的关联研究

发布时间：2017-05-09 12:11

  本文关键词：维生素D及其代谢通路遗传多态与结核病发病风险和预后的关联研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：背景与目的：结核病是由结核杆菌感染导致的一种慢性传染病。机体感染结核杆菌后的不同临床表现反映了结核杆菌的致病性与宿主免疫反应之间的平衡，免疫力低下影响机体清除结核杆菌的能力。在有效的抗结核药发明前，人们就发现日光照射具有意想不到的疗效，以后科学家逐步认识到从日光照射→维生素D代谢→抗结核免疫反应的分子通路。维生素D除了调节钙代谢和骨密度外，还是重要的免疫调节因子。维生素D在体内的代谢是一个复杂的过程，需要多个基因的共同参与。这些共同参与维生素D代谢的基因存在遗传多态，导致个体对结核病的遗传易感性存在差异。虽然近年来针对维生素D受体（vitamin D receptor,VDR）基因多态与结核病遗传易感性的研究取得了很大进展，但是很少有研究涉及维生素D代谢通路中其他关键基因如GC、RXRA、RXRB等，关于基因－基因间的联合效应以及与维生素D摄入水平间交互效应的研究更是十分匮乏，尚未见中国人群维生素D摄入水平及其代谢通路遗传多态在结核病人预后预测中作用的报导。基于上述背景，我们选择参与维生素D代谢的多个重要基因，采用大样本病例对照研究和前瞻性队列研究设计，运用现场流行病学调查方法和分子流行病学技术手段，旨在（1）探讨维生素D代谢通路中VDR、GC、RXRA、RXRB等基因多态和血清维生素D水平与结核病遗传易感性的关系，为识别高危个体、制定结核病预防和控制策略提供科学依据；（2）探讨维生素D代谢通路遗传多态和维生素D摄入水平对结核病患者预后的影响，为进一步开展个体化维生素D干预辅助治疗结核病提供理论依据和人群研究资料。 方法：本研究分别采用病例对照研究设计和前瞻性队列研究设计，病例来源于2008年至2012年从江苏泰兴、镇江、武进、张家港、南京等地招募的活动性肺结核病人（包括涂阳和涂阴病例），共1584例。对照组来自泰兴、镇江、南京、武进等地参加健康体检的居民，按年龄和性别与病例进行频数匹配，要求对照无结核病和恶性肿瘤病史，共1566例。获得知情同意后采用问卷调查表收集相关流行病学资料，并采集静脉血样用于维生素D的浓度检测和基因分型研究。所有病例自诊断之日起随访至抗结核疗程结束或出现结局，通常为6~8个月。血清25-羟基维生素D的浓度检测采用艾狄斯TM25羟基维他命D试剂盒（OCTEIA25-OH-VD）。本次研究选择维生素D代谢通路上4个主要基因VDR、GC、RXRA和RXRB。SNP位点筛选原则：文献报导潜在功能性多态位点；根据dbSNP数据库筛选潜在功能性多态位点（外显子区错义突变、5’UTR、5’neargene、3’UTR等），要求杂合度≥0.10，汉族人群MAF≥0.05。最终选择14个位点，其中VDR基因七个SNP：rs2228570，rs7975232，rs757343，rs11568820，rs731236，rs1544410，rs739837；GC基因四个SNP：rs16847024，rs3733359，rs4588，，rs7041；RXRA基因两个SNP：rs62576288，rs117846790；RXRB基因一个SNP：rs2076310。基因分型基于TaqMan分型技术，在ABI7900实时PCR仪（Applied Biosystems,Foster City, CA）上进行。数据录入采用Epidata3.1软件，数据库整理与分析运用SPSS20.0软件。采用χ2检验或t检验比较人口学特征、吸烟、饮酒等结核病发病相关因素以及等位基因频率和基因型频率在病例和对照间分布的差异。采用单因素和多因素logistic回归分析计算优势比（Odds Ratio, OR）及其95%可信区间（Confidence Interval, CI）。 结果：（1）结核病例组血清25-羟基维生素D浓度为32.94±23.35nmol/L，低于对照组41.79±16.57nmol/L，两者差异有统计学意义（t=6.768, P0.001）。单位点分析发现，VDR基因上rs739837、rs757343和rs7975232这3个位点的变异基因型能够显著降低肺结核的发病风险。与野生纯合子rs739837-GG基因型的个体比较，携带变异纯合子TT基因型的个体患病风险下降26%（调整OR=0.74，95%CI：0.55-0.99）。（2）结核病例随访研究发现血清25-羟基维生素D浓度与治疗结局的关联具有统计学意义，诊断时的维生素D浓度高者发生治疗失败的风险小于维生素D浓度低的病人，OR（95%CI）=0.95（0.91-0.99），P=0.043。单位点分析发现，RXRB基因上rs2076310位点的变异基因型与结核病治疗结局的关联具有统计学意义，与rs2076310-CC基因型比较，携带TT发生治疗失败的风险增加，OR（95%CI）=2.27（1.09-4.73），P=0.028。 结论：血清25-羟基维生素D浓度影响结核病发病风险和预后，而且结核病的发病风险和预后也与维生素D代谢通路基因的遗传多态有关。上述研究结果不仅为结核病的病因学预防和高危人群筛选提供了一定的科学依据，并且为结核病患者的个体化治疗和预后预测提供了一定的理论指导。
【关键词】：维生素D 代谢通路 遗传多态 结核 发病风险 预后
【学位授予单位】：南京医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R521;R181.3
【目录】：

• 中文摘要5-8
• Abstract8-11
• 前言11-15
• 第一部分 维生素 D 及其代谢通路遗传多态与结核病发病风险的关联研究15-32
• 一、对象与方法15-21
• 二、结果21-28
• 三、讨论与结论28-32
• 第二部分 维生素 D 及其代谢通路遗传多态与结核病预后的关联研究32-40
• 一、对象与方法32-33
• 二、结果33-36
• 三、讨论与结论36-40
• 总结40-41
• 参考文献41-46
• 文献综述46-56
• 参考文献53-56
• 附录56-59
• 附录一、常用名词缩略语56-57
• 附录二、硕士研究生期间发表文章57-58
• 附录三、相关试剂配置方法58-59
• 致谢59

【参考文献】

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1 马志明;肖唐;林国;刘健雄;谭耀驹;王云南;邝浩斌;谭守勇;;白介素-10基因多态性与肺结核病易感性的研究[J];广东医学;2007年08期

2 牟金金;杨敏;徐s

本文编号：352468