2014年深圳市流行的1型登革病毒分子溯源分析

发布时间：2017-07-15 19:20

  本文关键词：2014年深圳市流行的1型登革病毒分子溯源分析

  更多相关文章： 登革热 登革热病毒 E基因 序列测定 系统进化树

【摘要】：目的对2014年深圳市登革热(DF)流行时分离的登革热1型病毒株(DENV-1)进行E基因序列测定,了解其分子病毒学特征,探讨其可能来源。方法收集35份2014年深圳市DF患者急性期血清标本,用乳仓鼠肾细胞(BHK-21)分离DF病毒,并用逆转录-半套式聚合酶链反应(RT-PCR)反应对其进行型别鉴定。RT-PCR扩增全长E基因,测序并进行同源性与进化树分析。结果 35份血清样本中分离到DENV-1 21株。选取6株深圳DENV-1分离株测序,E基因全长1 485 bp,编码495个氨基酸。6株深圳市DENV-1分离株同源性为100.0%,其同源性与深圳市2010流行株接近,核苷酸和氨基酸同源性分别为99.5%和99.8%,与新加坡2009和日本2004流行株的核苷酸和氨基酸同源性最高达99.7%和100.0%。进化分析发现,深圳6株DENV-1属于基因型1型,与Shenzhen2010、Singpore2009、Japan2004的亲缘关系较近,在同一进化支上。结论2014年深圳市DENV-1属GⅠ亚型,最可能来源于东南亚一带,于2010年本地化而引起2014年DF流行。
【作者单位】： 南方医科大学附属深圳宝安医院;
【关键词】： 登革热 登革热病毒 E基因 序列测定 系统进化树
【基金】：深圳市宝安区科技计划项目(No:2015253)
【分类号】：R512.8;R181.3
【正文快照】： 登革热(dengue fever,DF)是由登革病毒(denguevirus,DENV)引起的一种严重的急性虫媒传染病。近十年来,登革热在全世界的发病率提高近30倍,波及全球100多个国家和地区,成为世界性的公共卫生问题[1]。在我国,登革热主要流行于广东、海南、广西、福建、台湾等南方及东南沿海省份

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