淮安市异性性传播途径感染HIV-1毒株的流行特征及分子进化研究

发布时间：2017-08-03 08:27

  本文关键词：淮安市异性性传播途径感染HIV-1毒株的流行特征及分子进化研究

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【摘要】：目的了解淮安市经异性性传播途径感染HIV-1流行毒株的流行特征、亚型分布及进化特点。方法以淮安籍HIV-1感染者为对象,收集相关流行病学资料,用巢式(RT-)PCR方法扩增env基因片段,测序并进行分子进化分析。结果淮安市经异性性传播途径感染的HIV-1基因亚型有5种,分别是CRF01_AE(53.68%,73/136)、CRF07_BC(18.38%,25/136)、CRF08_BC(0.09%,12/136)、B(14.71%,20/136)和A1(0.04%,6/136)。env基因的核苷酸同源性分析显示,淮安市流行毒株与广东、湖南、安徽、江苏分离株的同源性高。分子进化及遗传距离分析提示淮安市流行的CRF01_AE重组株分为2簇(Clade A和Clade B)。其中,Clade A的组内遗传距离在淮安市流行株HIV-1的各基因亚型中最大。同时发现,淮安市流行的CRF01_AE重组株的进化速率为3.82×10-3(95%HPD 3.49~4.18×10-3)替换/位点/年,tMRCA为14.3年。结论淮安市经异性性传播途径感染的HIV-1毒株存在多样性,CRF01_AE重组株是淮安市HIV-1的主要流行株,于1999年8月传入。
【作者单位】： 淮安市疾病预防控制中心;江苏省疾病预防控制中心;
【关键词】： HIV- 基因亚型 进化树 分子进化
【基金】：淮安市预防医学科研基金项目(No.hayf201504;hayf201505)
【分类号】：R512.91;R181.3
【正文快照】： ***人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency vi-rus,HIV)属于逆转录病毒科(Retroviridae)慢病毒属(Lentivirus),为单股正链RNA包膜病毒[1-2]。HIV基因组全长为9.8kb左右,包括env、gag、pol 3个结构基因,6个非结构基因(调节基因)以及5′、3′端的长末段重复序列(long termina

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本文编号：613421