淮安市男男性行为人群感染HIV-1的分子特征研究

发布时间：2017-08-09 13:41

  本文关键词：淮安市男男性行为人群感染HIV-1的分子特征研究

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【摘要】：目的了解江苏省淮安市男男性行为(men who have sex with men,MSM)人群感染HIV-1的基因亚型分布和分子特征。方法以现住址为淮安的HIV-1确证感染者为研究对象,利用巢式逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法扩增env基因片段,测序并进行分子进化分析。结果淮安市MSM人群感染的HIV-1基因亚型有5种,分别是CRF01-AE(68.21%,118/173)、CRF07-BC(16.76%,29/173)、CRF08-BC(0.58%,1/173)、CRF55-01B(1.16%,2/173)及B亚型(13.29%,23/173)。系统进化分析显示淮安流行的毒株与云南、辽宁、广西、江苏及湖南分离的同源性高,在进化树上与对应亚型的参考株聚集成簇。流行的优势亚型CRF01-AE中共检测出58个单倍型,单多样性指数(0.999)和核苷酸的多样性指数(0.150)显示淮安市株具有较高的遗传多样性。结论淮安市MSM人群感染的HIV-1存在多样性,其中CRF55-01B为首次在淮安市MSM感染人群发现,CRF01-AE是淮安市MSM人群中感染的主要流行株。
【作者单位】： 淮安市疾病预防控制中心检验科;江苏省疾病预防控制中心免疫规划所;
【关键词】： HIV- 基因 分子结构
【基金】：淮安市科技计划项目(HAS2015019-5) 淮安市预防医学科研基金(hayf201504,hayf201505)
【分类号】：R512.91;R181.3
【正文快照】： 人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)为逆转录病毒科慢病毒属病毒[1-2]。HIV基因组特点为单股正链RNA,全长为9.8 kb左右,含有9个基因(gag、pol、env、tat、nef、vif、vpr、vpx、rev)。HIV引起人获得性免疫缺陷综合征(acquired immune deficiency syndrome,AID

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