江苏口岸鼠类监测与重点鼠类mtDNA-Cytb基因数据库的建立

发布时间：2017-09-14 02:30

  本文关键词：江苏口岸鼠类监测与重点鼠类mtDNA-Cytb基因数据库的建立

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【摘要】：[目的]监测江苏口岸本底鼠类的种类及其病原体携带情况,建立一套重要鼠类的mt DNA-Cytb基因数据库。[方法]2014年5月~2015年4月,在江苏17个口岸采用夹夜法捕获本底鼠样;首先通过形态特征鉴定捕获的鼠样,在生物安全柜中解剖鼠样取其肝脏与肺脏,分别提取鼠类肝脏的DNA模板与肺脏的RNA模板;通过PCR扩增和测序,测定鼠类的Cytb基因序列,通过BLAST与NCBI的基因数据库比对,以同源性最高为分子鉴定结果。通过荧光PCR筛查捕获鼠样中的鼠疫杆菌和汉坦病毒感染情况,对阳性结果再进行测序验证与分型。最后将江苏各口岸代表性鼠样的Cytb基因序列信息与各口岸的地理分布信息结合,构建江苏口岸本底鼠类的基因特征数据库,建立Cytb基因的系统发育树。[结果]共采集鼠样418份,其中褐家鼠231只、黄胸鼠38只、小家鼠99只、黑线姬鼠44只和大麝，

本文编号：847336