2009～2013年杭州地区甲型流感病毒基质蛋白基因的遗传进化分析

发布时间：2017-09-19 08:27

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【摘要】：为调查2009年至2013年杭州地区甲型流感病毒基质蛋白基因(Matrix protein,M)的遗传进化特征,本文对5个连续的流行季中A(H1N1)pdm09亚型和季节性A(H3N2)亚型流行株的M基因序列进行了深入的研究分析。从两家当地三级甲等医院发热门诊室共收集5675份流感样病例样本。利用病毒分离与实时荧光定量PCR法对样本内所含病毒进行鉴定,发现流感病毒阳性率为20.46%,其中甲型流感病毒872株。从5个流行季的9个时间段内,随机选取了76株甲型流感病毒进行M基因全序列测定和遗传进化分析。研究发现,杭州地区甲型流感病毒烷胺类耐药相关位点M2蛋白的S31N突变率接近100%。两株A(H1N1)pdm09本地流行株还发生了V27A/S31N或V27I/S31N双位点耐药突变。另外,在一株季节性A(H3N2)亚型流行株上还观察到R45H/S31N双位点耐药突变。基于M基因序列进行系统发育分析发现,无论是病毒亚型间还是各流行季间,M基因进化速率明显低于血凝素蛋白基因(Haemagglutinin,HA)和神经胺酸酶蛋白基因(Neuraminidase,NA)。对M1和M2蛋白的变异进行正向选择压力分析发现,M2蛋白的编码区所受到的选择压力要远远高于M1蛋白,且A(H1N1)pdm09亚型流行株所受到的选择压力要高于季节性A(H3N2)亚型。甲型流感病毒M基因的遗传进化研究对判断病毒的进化方向、预防和控制病毒的暴发流行具有重要的参考价值。
【作者单位】： 浙江中医药大学基础医学院;杭州市疾病预防控制中心;
【关键词】： 甲型流感病毒 基质蛋白 进化 突变
【基金】：国家自然科学基金(31301098) 浙江省医药卫生科技计划(2013KYB219) 杭州市卫生科技计划(2011A055)资助
【分类号】：R373.13;R181.2
【正文快照】： 临床上常用的抗流感病毒药物有两类,即针对基质蛋白离子通道的阻滞剂金刚烷胺类(Amanta-dine)和特异性结合神经氨酸酶的抑制剂。而目前流行的绝大多数流感病毒对烷胺类药物都有很强的耐药性,使得包括中国和美国在内的大多数国家几乎都放弃了烷胺类药物的使用。病毒基质蛋白基

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