基于微卫星DNA标记的山东微山湖区放养钉螺遗传结构分析

发布时间：2017-10-02 01:15

  本文关键词：基于微卫星DNA标记的山东微山湖区放养钉螺遗传结构分析

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【摘要】：目的分析在山东微山湖地区长期放养的湖北钉螺(Oncomelania hupensis)群体与其来源地江苏省长江江滩钉螺群体之间的基因差异。方法收集江苏省扬州市江都区、仪征市和丹阳市、南京市六合区的长江钉螺以及山东省济宁市微山湖独山岛的钉螺。微山湖区放养的钉螺来自于扬州市江都区,放养时间为10年(至2014年)。选择A18、C22、T4-33、T6-17等4对微卫星位点对钉螺群体进行PCR扩增,分析各钉螺群体的等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)和群体间遗传差异平均数等指标,并进行分子变异方差分析(AMOVA),用非加权组平均法(UPGMA)和邻接法(NJ)构建系统进化树描述群体遗传分化及聚类情况。使用Mantel检验探讨遗传距离与地理距离的相关性。结果本研究收集5个钉螺群体共103只钉螺。江都、仪征、丹阳、六合、微山湖群体的Na分别为7.50、12.50、10.00、11.50和12.75;Ho分别为0.16、0.27、0.17、0.30和0.22;He分别为0.81、0.91、0.84、0.90和0.92。微山湖群体的3个遗传多样性指标均在较高水平,提示有较好的遗传多样性,但与其他群体差异无统计学意义(P0.05)。微山湖与江都钉螺群体间遗传差异平均数最小(0.79),丹阳群体与其他群体之间差异较大,为0.87~0.97。AMOVA分析的遗传变异主要来源于钉螺个体间(占92.50%)。NJ和UPGMA系统进化树显示,江都和微山湖的钉螺群体聚为一支,仪征和六合的钉螺群体聚为一支,丹阳钉螺群体与其他4个群体聚为一支。Mantel检验显示遗传距离与地理距离没有相关性。结论江苏省长江钉螺群体与微山湖钉螺群体基因多样性均较高,微山湖地区放养的钉螺与来源地的长江钉螺群体尚未出现明显遗传分化。
【作者单位】： 江苏省血吸虫病防治研究所 国家卫生计生委寄生虫病预防与控制技术重点实验室 江苏省寄生虫与媒介控制技术重点实验室;山东省医学科学院 山东省寄生虫病防治研究所;
【关键词】： 微卫星DNA 湖北钉螺 微山湖
【基金】：国家重大传染病科技专项(No.2012ZX10004-220) 国家自然科学基金(No.81101275)~~
【分类号】：R184.38
【正文快照】： 作者单位:1江苏省血吸虫病防治研究所,国家卫生计生委寄生虫病预防与控制技术重点实验室,江苏省寄生虫与媒介控制技术重点实验室,无锡214064;2山东省医学科学院,山东省寄生虫病防治研究所,济宁272033引物Primer引物序列(5′→3′)Primer sequence(5′→3′)重复序列Repeat mot，

本文编号：956727