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Apoe -/- 小鼠动脉粥样硬化差异基因及精制血府胶囊早期干预研究

发布时间:2021-01-15 19:22
  实验一不同周龄Apoe-/-基因敲除小鼠动脉粥样硬化炎症差异基因的演变目的:利用Agilent表达谱基因芯片筛查Apoe-/-基因敲除小鼠在10周龄、15周龄、25周龄不同时段差异基因的表达谱变化,并对筛选出的显著变化的差异(炎症)基因白细胞介素-12 α (IL-12α)、干扰素(Ifng)、基质金属蛋白酶-12(MMP12)、生长分化因子-15(GDF-15)、白细胞介素-1β (IL-1β)进行验证和演变分析。方法:60只Apoe-/-小鼠,雄性,随机分为3组,每组20只。分别设定10周龄为动脉粥样硬化(AS)的初期组、15周龄为AS早期组、25周龄为AS晚期组。相同遗传背景C57BL/6J野生型小鼠作为空白对照组(25周龄)。小鼠正常饮食饮水,在小鼠对应周龄时麻醉后处死,取血及分离主动脉弓,液氮保存。(1)不同周龄的差异基因筛选,提取总RNA检验合格,反转录成双链cDNA,再进一步合成用Cyanine-3-CTP(Cy3)标记的cRNA。标记好的cRNA和芯片杂交,洗脱后利用Agilent扫描仪扫描得到原始图像。采用Feature Extraction软件处理原始图像提取原始数... 

【文章来源】:中国中医科学院北京市

【文章页数】:72 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

Apoe -/- 小鼠动脉粥样硬化差异基因及精制血府胶囊早期干预研究


10w,15}r,25w与对照组相比上调及下调基因数

对照组,中共,异基因


15w?VS对照组的差异基因,扣掉lOw?VS对照组、巧W?VS对54照组的差异基因??25w?VS对照组的差异基因,扣掉lOw?VS对照组、15w?VS对59照组的差异基因??lOw?VS对照组与15w?VS对照组中共有的差异基因,扣掉25w?VS?19对照组中的差异基因??lOwvs对照狙与25w?VS对照组中共有的差异基因,扣掉15wvs?34对照组中的差异基因??15WVS对照组与25w?VS对照组中共有的差异基因,扣掉lOw?VS?11对照组中的差异基因??lOw?VS对照组、1日W?VS对照狙、25w?VS对照组中共有的的差18异基因??

基因差异,火山,组间,基因


Apoe?/小鼠动脉粥样硬化差异基因及精制血府胶免早期干巧研系??2.2.3差异基因火山图分布结果:??将比较所产生的差异表达情况反映到火山图中,X轴是差异倍数为底取对??数的值,Y轴是p-value值为底取负对数的值。在设生物学重复的情况下(即??使用统计分析法分析差异表达)将给出火山图。其中灰色的点表示Fold绝对值小??于2,?P值>0.05的基因。红色点:Fold绝对值大于或等于2,且P《0.?05的基因,??这些基因为显著性差异基因。可W从图中直观的看出相对于其他组间比较,lOw??与15w相比显著差异基因最少。而与对照组相比,各组显著差异基因数量较大。??


本文编号:2979377

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