小鼠脊髓损伤后LncRNA差异性表达谱

发布时间：2017-10-07 05:22

  本文关键词：小鼠脊髓损伤后LncRNA差异性表达谱

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【摘要】：目的:制作小鼠脊髓损伤模型后利用基因芯片技术,建立小鼠脊髓损伤后LncRNA和mRNA差异性表达谱,并作出初步分析。方法:1.ICR小鼠(SPF级别,20-25g),戊巴比妥钠腹腔注射麻醉后,利用MASCIS撞机仪制作标准小鼠脊髓损伤模型,装备10g撞击棒,自2.5cm处自由落体撞击第10椎体层面脊髓中央,小鼠双下肢出现强制性抽搐,尾巴甩向一侧后,出现双下肢瘫痪。视为造模成功标志。2.以损伤后脊髓中心为中点,上下各5mm,提取损伤脊髓的总RNA,利用基因芯片技术对提取的总RNA进行扫描,得到小鼠脊髓损伤后LncRNA和mRNA差异性表达谱。3.利用生物信息学方法对小鼠脊髓损伤后LncRNA和mRNA差异性表达谱进行分析。结果:1.小鼠脊髓损伤模型制作成功,并对提取的总RNA进行质量评估,质量可靠。2.利用基因芯片技术得到小鼠脊髓损伤后LncRNA和mRNA差异性表达谱。观察差异性表达基因数目,并制作基因聚类分析热图。小鼠脊髓损伤后1天和3天,LncRNA差异性表达数目较少,而在损伤后7天,其数目有剧烈变化,而在21天后,差异性表达逐渐回落。3.生物信息学发现小鼠脊髓损伤后差异性LncRNA和mRNA GO分析涉及条目主要为运输、细胞粘附等,KEGG分析其涉及主要生物学通路为神经受体配体信号通路、磷酸化信号通路等。制作出编码基因与LncRNA动力调控网络图。结论:LncRNA在小鼠脊髓损伤后发生了差异性表达。
【关键词】：长联非编码RNA 小鼠脊髓损伤 基因芯片
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R651.2
【目录】：

• 中文摘要4-5
• Abstract5-8
• 引言8-10
• 第一章 小鼠脊髓损伤模型建立10-17
• 引言10
• 1.主要材料与仪器10-11
• 2.实验方法11-13
• 3.结果13-15
• 4.讨论15-17
• 第二部分 基因芯片实验17-29
• 引言17
• 1.主要材料与仪器17-18
• 2.实验方法18-24
• 3.结果24-27
• 4.讨论27-29
• 第三部分 生物信息学分析29-41
• 引言29-30
• 1.实验材料30
• 2.实验方法30-34
• 3. 实验结果34-40
• 4.讨论40-41
• References41-44
• 综述44-52
• References49-52
• 攻读学位期间公开发表的论文52-53
• 致谢53-54

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本文编号：987160