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对基于网络结构分析疾病敏感基因方法的改进

发布时间:2018-03-18 00:00

  本文选题:基因网络 切入点:肾透明细胞癌 出处:《中国海洋大学学报(自然科学版)》2017年S1期  论文类型:期刊论文


【摘要】:基于网络结构分析法研究疾病敏感基因方法是具有重要理论与实际意义的课题。本文分别对有无肾透明细胞癌的肾组织的基因表达谱做秩和检验,筛出表达差异较大的基因作为候选基因。而后对筛选得到的基因构建互信息网,基于网络结构的7个统计量,提出了"面差"的新概念,进而提出一种新的筛选可能对疾病发展过程产生重大影响的结构性关键基因的方法,并且由此得到了8个基因作为肾透明细胞癌的潜在性致病关键基因。癌症的实验研究表明得到的8个基因中有6个是与肾细胞透明癌的形成与发展有关,并且预测剩余的2个基因可能对肾透明细胞癌的产生和发展有影响。
[Abstract]:It is of great theoretical and practical significance to study the method of disease sensitive genes based on network structure analysis. In this paper, the gene expression profiles of renal tissues with or without clear renal cell carcinoma were examined by rank sum test. A new concept of "plane difference" was put forward based on seven statistics of network structure to construct the mutual information network for the genes that expressed widely different genes as candidate genes. A new method for screening structural key genes that may have a significant impact on the course of disease development is proposed. Eight genes were obtained as the key genes for the latent pathogenicity of renal clear cell carcinoma, and six of the eight genes were related to the formation and development of clear renal cell carcinoma. It is also predicted that the remaining 2 genes may have an effect on the production and development of renal clear cell carcinoma.
【作者单位】: 中国海洋大学数学科学学院;
【基金】:国家自然科学基金项目(11271341)资助~~
【分类号】:R737.11

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本文编号:1627061

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