人类精浆糖基化蛋白质组学研究
【学位授予单位】:南京医科大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R698.2
【图文】:
20图 1:人类精浆 N 联糖基化蛋白质组学的特征,及与其他已知糖蛋白的对比。(A)五次生物学重复鉴定的 N 联糖基化蛋白质覆盖率;(B)五次生物学重复鉴定的 N 联糖基化位点覆盖率;(C)用 MotifX. WebLogo 3 衍生的 N 联糖基化相对频率图及共有序列;(D)精浆糖基化蛋白质谱中蛋白质上分布的 N 联糖基化位点数目。Rolland 等总结了既往的蛋白质谱数据库,总结 2545 种不同的人类精浆蛋白质[40]。在这些蛋白质中,我们的研究表明其中 263 个为糖基化蛋白质(图2A)。在我们的糖基化蛋白质谱系,109 个糖基化蛋白质是第一次被鉴定到,在以往的精浆蛋白质组学数据库中没有提及。糖基化位点的周围序列(二端各6 个氨基酸)是糖基化修饰的调控序列,在 dbPTM 数据库中,通常用这些调
我们的研究表明其中 263 个为糖基化蛋白质(图2A)。在我们的糖基化蛋白质谱系,109 个糖基化蛋白质是第一次被鉴定到,在以往的精浆蛋白质组学数据库中没有提及。糖基化位点的周围序列(二端各6 个氨基酸)是糖基化修饰的调控序列,在 dbPTM 数据库中,通常用这些调
釗湎嗷プ饔霉叵怠?6 个基因通过 147 个相互作用关联(图3A)。关联最多的基因是 FN1(22 个相互关联基因),其次是 TGFB1(19 个相互关联基因),其他还有比如 CLU,SERPINA1,TIMP1 也都与其他糖基化蛋白质有广泛的相互作用关系。
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