M受体阻滞剂治疗大鼠膀胱出口梗阻后差异表达基因的筛选与分析
发布时间:2021-05-11 14:48
目的:研究M受体阻滞剂治疗大鼠膀胱出口梗阻后,对膀胱功能调控的关键基因及信号通路。方法:构建大鼠膀胱出口部分梗阻(pBOO)模型,采用全基因组mRNA测序,筛选差异表达的DEGs,使用R语言对DEGs进行GO功能注释和KEGG通路分析,采用String 数据库构建蛋白-蛋白互作网络,使用Cytoscape筛出Hub基因。结果:pBOO后共筛选出328个DEGs,该DEGs参与平滑肌、免疫、细胞外基质相关功能调控。给予M受体阻滞剂后发现DEGs主要参与局部黏附,白细胞跨内皮迁移,细胞外基质受体相互作用等炎症和细胞外基质沉积的调节。MCC算法筛选出Cd34、Col4a1等Hub基因。结论:BOO后给予M受体阻滞剂能调控Cd34、Col4a1等炎症及纤维化基因的表达,同时能调控细胞黏附、炎症、细胞外基质沉积的相关通路。
【文章来源】:中国研究型医院. 2020,7(03)
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
引言
1资料与方法
1.1大鼠pBOO模型的建立
1.2基因芯片检测
1.3基因芯片数据分析及统计
2结果
2.1成功建立大鼠pBOO模型
2.2 pBOO后膀胱差异基因的筛选及功能变化
2.3 M受体治疗后膀胱差异基因及功能的变化
2.4 M受体治疗后膀胱差异基因的PPI蛋白调控网络和Hub基因筛选
3讨论
本文编号:3181595
【文章来源】:中国研究型医院. 2020,7(03)
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
引言
1资料与方法
1.1大鼠pBOO模型的建立
1.2基因芯片检测
1.3基因芯片数据分析及统计
2结果
2.1成功建立大鼠pBOO模型
2.2 pBOO后膀胱差异基因的筛选及功能变化
2.3 M受体治疗后膀胱差异基因及功能的变化
2.4 M受体治疗后膀胱差异基因的PPI蛋白调控网络和Hub基因筛选
3讨论
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