核心蛋白聚糖在常染色体显性多囊肾病进展中的作用及机制研究
发布时间:2021-06-30 15:40
研究目的:常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant kidney disease,ADPKD)作为最常见的遗传性肾病,主要由PKD1或PKD2基因突变引起,导致肾脏囊肿的形成和扩张。过去的40多年,ADPKD的进展、诊断和治疗已取得巨大的进步,但是ADPKD目前仍是难以治愈的疾病,缺少有效的干预及治疗手段。ADPKD作为常见的遗传性肾病,基因突变是探索疾病本身发生发展机制的核心。PKD1或PKD2基因突变可导致一系列的信号转导通路发生异常,异常激活或抑制的信号通路相互交联,形成复杂的网络系统。通过对2项ADPKD患者肾组织表达谱芯片数据集进行生物信息学分析,发现核心节点基因DCN在多囊肾病中是异常表达,与多种差异表达基因存在生物学关联,参与多种信号转导通路。DCN基因编码蛋白核心蛋白聚糖(decorin,DCN)是细胞外基质的成分之一,属于富含亮氨酸的小分子多糖家族成员,通过多种机制发挥抗肿瘤,调节新生血管形成、抗纤维化等生物学功能。DCN蛋白作为具有广泛生物学效应的小分子蛋白,在慢性肾脏病进展中起到抗炎和抗纤维化的作用。深入探索DCN在ADPKD中的生物学功能,可能...
【文章来源】:中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校
【文章页数】:107 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
差异表达基因功能富集图1-2差异表达基因功能富集
海军军医大学博士学位论文- 20 -图1-3 差异表达基因信号通路富集(3)蛋白质相互作用网络,关键基因和信号通路模块分析共同表达的561个DEGs(291个上调基因,270个下调基因)输入String在线的数据集,获取蛋白质相互作用网络,获得421个节点基因(图1-4A)。在这些421个节点基因中,根据蛋白质相互作用联系评分,获得34个中心节点基因,排名前十的节点基因分别是ALB, JUN, 胰岛素样生长因子1 (IGF1), 成纤维细胞生长因子2 (FGF2), α平滑肌肌动蛋白2 (ACTA2),纤溶酶原 (PLG), EHHADH, 波形蛋白(VIM)和 核心蛋白聚糖(DCN)。根据节点基因打分的重要性,在网络
蛋白质相互作用网络图
本文编号:3258022
【文章来源】:中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校
【文章页数】:107 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
差异表达基因功能富集图1-2差异表达基因功能富集
海军军医大学博士学位论文- 20 -图1-3 差异表达基因信号通路富集(3)蛋白质相互作用网络,关键基因和信号通路模块分析共同表达的561个DEGs(291个上调基因,270个下调基因)输入String在线的数据集,获取蛋白质相互作用网络,获得421个节点基因(图1-4A)。在这些421个节点基因中,根据蛋白质相互作用联系评分,获得34个中心节点基因,排名前十的节点基因分别是ALB, JUN, 胰岛素样生长因子1 (IGF1), 成纤维细胞生长因子2 (FGF2), α平滑肌肌动蛋白2 (ACTA2),纤溶酶原 (PLG), EHHADH, 波形蛋白(VIM)和 核心蛋白聚糖(DCN)。根据节点基因打分的重要性,在网络
蛋白质相互作用网络图
本文编号:3258022
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